More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0838 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0838  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 273 aa  559  1e-158  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346138 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0074  AraC-type DNA-binding protein, response regulator  37.23 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1050  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 773 aa  69.3  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0197  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160748  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0182  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 326 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0556726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  25.77 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1711  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.311162  normal  0.0412412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4009  helix-turn-helix domain-containing protein  34.88 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125602  normal  0.35131 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1138  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283837  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1536  putative AraC family DNA-binding protein  34.88 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0013  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 485 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344073  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1388  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00534804  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0149  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0427  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1497  AraC family transcription regulator  29.2 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141505  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1411  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1151  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0648007  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  33.33 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  37.93 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1189  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 550 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.459992  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1731  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  33.72 
 
 		 507 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  33.72 
 
 		 507 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  37.93 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  37.93 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2237  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1722  two component AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 508 aa  62.4  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  35.63 
 
 		 546 aa  61.6  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 506 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0618  two component AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2786  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173826  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0060  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4155  xylose operon regulatory protein  29.13 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.664411  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  34.74 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1148  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00767065  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4098  xylose operon regulatory protein  29.13 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0147  two component transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 525 aa  59.7  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00274  transcriptional regulator, AraC family protein  39.51 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1066  transcriptional regulator, AraC family  29.73 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2452  two component transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 		 509 aa  59.3  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0693402  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4740  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287591  normal  0.0863508 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1518  transcriptional regulator, AraC family  20.37 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1645  two component transcriptional regulator, AraC family  34.15 
 
 		 526 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168722  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  26.15 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0990  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 779 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4141  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0368552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6978  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain-like protein  33.33 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3979  two component transcriptional regulator, AraC family  31.5 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1069  transcriptional regulator, AraC family  29.76 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0975  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3855  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 313 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4513  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 313 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.24786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2253  two component AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 532 aa  57  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0985  transcriptional regulator, AraC family  32.94 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1337  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 600 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.477585 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  27.35 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3944  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4407  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.332097 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  31.11 
 
 		 519 aa  56.6  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  31.46 
 
 		 502 aa  56.2  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1394  two component AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 523 aa  56.2  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0374  transcriptional regulator, AraC family  25.74 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5791  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0219  helix-turn-helix domain-containing protein  29.36 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.882333  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0342  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 778 aa  55.8  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3035  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25 
 
 		 380 aa  55.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3601  response regulator receiver domain-containing protein  36 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6000  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 531 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  30.21 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  30.68 
 
 		 519 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  30.21 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 440 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1416  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.813304  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0773  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  30.21 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0385  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 766 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0591  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  26.77 
 
 		 346 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1452  AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 503 aa  55.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  30.21 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  30.21 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3450  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 492 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 338 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>