62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1998 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1998  transcription activator effector binding protein  100 
 
 		 153 aa  313  4e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000299964  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2199  transcription activator, effector binding  34.64 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2865  transcription activator effector binding  37.84 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1918  transcription activator effector binding  33.1 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00982966  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3688  transcription activator effector binding  32.03 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0763  transcription activator effector binding  31.58 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000404433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4749  transcription activator effector binding  32.39 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5066  hypothetical protein  33.1 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5162  hypothetical protein  33.1 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5039  hypothetical protein  33.1 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4799  hypothetical protein  33.1 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5072  hypothetical protein  32.17 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4660  DNA-binding protein  32.39 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5068  DNA-binding protein YobU  31.69 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0175  hypothetical protein  30.99 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4641  DNA-binding protein  31.69 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0019  DNA-binding protein  29.01 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0711  transcription activator effector binding  30.82 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1875  hypothetical protein  31.17 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3397  transcription activator effector binding  32.1 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000497279  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06778  hypothetical protein  34.04 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3427  transcription activator effector binding  29.85 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1824  transcription activator effector binding  27.21 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1456  transcription activator, effector binding  26.42 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259797  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1557  transcription activator effector binding  27.04 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2606  transcription activator, effector binding protein  29.94 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0560  hypothetical protein  31.29 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.754603  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0107  hypothetical protein  32.37 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0580328  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1757  hypothetical protein  29.01 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2705  transcription activator, effector binding  29.3 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7160  transcription activator effector binding protein  25.16 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46886  normal  0.0205342 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0189  transcription activator effector binding  25.49 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.4925  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2787  transcription activator effector binding  26.11 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.688559 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2786  transcription activator, effector binding  27.85 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2539  transcription activator, effector binding  29.3 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1563  transcription activator effector binding  26.42 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1592  transcription activator effector binding  26.42 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0171  transcription activator, effector binding  25.49 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1342  CTA2 subfamily 1 protein  30.34 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0548  transcription activator, effector binding  28.19 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.283386 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2542  transcription activator, effector binding  26.42 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1034  transcription activator effector binding  33.06 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2446  transcription activator, effector binding  27.74 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.88127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3143  transcription activator effector binding  26.67 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1440  transcription activator effector binding subunit  30.28 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2436  transcription activator effector binding protein  22.97 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  0.052404 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  29.36 
 
 		 279 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0283  CTA2 subfamily 1 protein  28.57 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189572  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  28.44 
 
 		 279 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1353  transcription activator effector binding  24.84 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.266351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 300 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 300 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 300 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 300 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 300 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2308  transcription activator effector binding protein  23.45 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.20456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 300 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 300 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 300 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 300 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4077  transcription activator effector binding  29 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  30.84 
 
 		 277 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.367426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>