46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2787 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2787  transcription activator effector binding  100 
 
 		 149 aa  313  5e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.688559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1563  transcription activator effector binding  99.33 
 
 		 154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1592  transcription activator effector binding  98.66 
 
 		 154 aa  309  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1557  transcription activator effector binding  95.97 
 
 		 154 aa  302  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1456  transcription activator, effector binding  90.6 
 
 		 154 aa  284  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259797  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2705  transcription activator, effector binding  68.46 
 
 		 149 aa  229  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1757  hypothetical protein  67.11 
 
 		 159 aa  226  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2539  transcription activator, effector binding  67.11 
 
 		 149 aa  226  9e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2606  transcription activator, effector binding protein  65.77 
 
 		 149 aa  219  9e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2786  transcription activator, effector binding  48.65 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3143  transcription activator effector binding  49.28 
 
 		 165 aa  147  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2542  transcription activator, effector binding  43.92 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06778  hypothetical protein  39.19 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0107  hypothetical protein  37.76 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0580328  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1824  transcription activator effector binding  43.36 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0548  transcription activator, effector binding  33.54 
 
 		 174 aa  107  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.283386 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0560  hypothetical protein  32.93 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.754603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0189  transcription activator effector binding  38.71 
 
 		 156 aa  98.6  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.4925  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0171  transcription activator, effector binding  38.71 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3397  transcription activator effector binding  36.81 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000497279  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0019  DNA-binding protein  33.77 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1875  hypothetical protein  36.13 
 
 		 154 aa  84  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0283  CTA2 subfamily 1 protein  35.76 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189572  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1440  transcription activator effector binding subunit  35.21 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2199  transcription activator, effector binding  32.05 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1918  transcription activator effector binding  28.38 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00982966  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2446  transcription activator, effector binding  28.48 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.88127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7160  transcription activator effector binding protein  25.17 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46886  normal  0.0205342 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1342  CTA2 subfamily 1 protein  31.47 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1998  transcription activator effector binding protein  26.11 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000299964  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2308  transcription activator effector binding protein  30.28 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.20456 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5072  hypothetical protein  26.75 
 
 		 158 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0175  hypothetical protein  26.75 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1034  transcription activator effector binding  29.2 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4660  DNA-binding protein  28.03 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4749  transcription activator effector binding  26.11 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5068  DNA-binding protein YobU  26.35 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3427  transcription activator effector binding  29.37 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1692  hypothetical protein  26.21 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2436  transcription activator effector binding protein  25.17 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  0.052404 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5039  hypothetical protein  27.39 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4799  hypothetical protein  27.39 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5162  hypothetical protein  27.39 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2865  transcription activator effector binding  27.33 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0763  transcription activator effector binding  26.75 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000404433  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  28.74 
 
 		 282 aa  40  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>