26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1692 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1692  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  283  5.999999999999999e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0283  CTA2 subfamily 1 protein  35.33 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189572  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1440  transcription activator effector binding subunit  37.59 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0107  hypothetical protein  31.79 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0580328  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2542  transcription activator, effector binding  29.5 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3143  transcription activator effector binding  30.14 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2786  transcription activator, effector binding  28.06 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1557  transcription activator effector binding  26.9 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1563  transcription activator effector binding  27.59 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1592  transcription activator effector binding  27.59 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1824  transcription activator effector binding  26.62 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3397  transcription activator effector binding  27.33 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000497279  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3427  transcription activator effector binding  28.78 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2787  transcription activator effector binding  26.21 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.688559 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1456  transcription activator, effector binding  26.9 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259797  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0171  transcription activator, effector binding  25.74 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2606  transcription activator, effector binding protein  28.57 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0189  transcription activator effector binding  25 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.4925  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2705  transcription activator, effector binding  27.86 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2539  transcription activator, effector binding  27.86 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06778  hypothetical protein  26.35 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1757  hypothetical protein  27.86 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2308  transcription activator effector binding protein  26.35 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.20456 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1342  CTA2 subfamily 1 protein  27.54 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2865  transcription activator effector binding  30.66 
 
 		 149 aa  42.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1034  transcription activator effector binding  29.08 
 
 		 128 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>