42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3688 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3688  transcription activator effector binding  100 
 
 		 153 aa  312  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2865  transcription activator effector binding  54.42 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1918  transcription activator effector binding  42.47 
 
 		 148 aa  121  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00982966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0175  hypothetical protein  34.39 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5068  DNA-binding protein YobU  33.78 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2199  transcription activator, effector binding  38.46 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4660  DNA-binding protein  33.12 
 
 		 158 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4799  hypothetical protein  33.11 
 
 		 159 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5162  hypothetical protein  33.11 
 
 		 159 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5039  hypothetical protein  33.11 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5066  hypothetical protein  33.78 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4641  DNA-binding protein  33.11 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4749  transcription activator effector binding  33.12 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1998  transcription activator effector binding protein  32.03 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000299964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5072  hypothetical protein  31.21 
 
 		 158 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1875  hypothetical protein  27.92 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0019  DNA-binding protein  31.87 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7160  transcription activator effector binding protein  29.05 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46886  normal  0.0205342 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3427  transcription activator effector binding  34.51 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2308  transcription activator effector binding protein  36.6 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.20456 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2705  transcription activator, effector binding  30.5 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2928  transcription activator effector binding protein  29.61 
 
 		 185 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.314738 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2539  transcription activator, effector binding  29.79 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0171  transcription activator, effector binding  28.21 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2606  transcription activator, effector binding protein  28.37 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0189  transcription activator effector binding  28.21 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.4925  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0711  transcription activator effector binding  28.57 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0763  transcription activator effector binding  30.99 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000404433  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0283  CTA2 subfamily 1 protein  28.66 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189572  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1757  hypothetical protein  28.67 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2542  transcription activator, effector binding  29.88 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1824  transcription activator effector binding  27.81 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1440  transcription activator effector binding subunit  29.8 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06778  hypothetical protein  32.41 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1342  CTA2 subfamily 1 protein  27.7 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2436  transcription activator effector binding protein  25.68 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  0.052404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2446  transcription activator, effector binding  29.25 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.88127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3143  transcription activator effector binding  30 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3397  transcription activator effector binding  27.48 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000497279  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1034  transcription activator effector binding  28.21 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  20.25 
 
 		 300 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0548  transcription activator, effector binding  24.67 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.283386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>