208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2475 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  100 
 
 		 294 aa  586  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  56.58 
 
 		 160 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  57.14 
 
 		 183 aa  195  6e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  50 
 
 		 166 aa  188  8e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  52.44 
 
 		 167 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  49.68 
 
 		 164 aa  178  9e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  53.46 
 
 		 175 aa  176  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  53.21 
 
 		 161 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  54.32 
 
 		 167 aa  169  7e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  51.83 
 
 		 166 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  49.07 
 
 		 164 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  48.72 
 
 		 183 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  48.72 
 
 		 162 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  44.23 
 
 		 166 aa  149  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  42.77 
 
 		 167 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  44.94 
 
 		 171 aa  142  5e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  47.01 
 
 		 163 aa  129  6e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  46.88 
 
 		 155 aa  122  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  45.14 
 
 		 181 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  44.68 
 
 		 166 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  46.67 
 
 		 143 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  46.67 
 
 		 143 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  44.12 
 
 		 151 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  38.58 
 
 		 135 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  40.15 
 
 		 155 aa  106  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  36.23 
 
 		 205 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  36.63 
 
 		 182 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  37.66 
 
 		 196 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  37.91 
 
 		 172 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  38.51 
 
 		 172 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  44.19 
 
 		 139 aa  100  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  44.62 
 
 		 139 aa  99.8  5e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  50 
 
 		 129 aa  99.4  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  42 
 
 		 241 aa  99.4  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  42.45 
 
 		 145 aa  99.4  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  41.48 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  40.56 
 
 		 231 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  42.96 
 
 		 231 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  49.04 
 
 		 142 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  40.69 
 
 		 251 aa  97.1  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  42.11 
 
 		 240 aa  96.3  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  42.96 
 
 		 230 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  40.3 
 
 		 162 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  42.06 
 
 		 138 aa  95.9  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  35.77 
 
 		 144 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  38.06 
 
 		 162 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  33.95 
 
 		 161 aa  95.1  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  38.3 
 
 		 235 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  41.48 
 
 		 232 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  40 
 
 		 142 aa  94  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  42.14 
 
 		 239 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  36.02 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  40.12 
 
 		 230 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  41.79 
 
 		 133 aa  92.8  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  41.48 
 
 		 230 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  41.13 
 
 		 147 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  41.18 
 
 		 234 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  41.91 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  40.74 
 
 		 256 aa  90.1  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  40.74 
 
 		 147 aa  90.1  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  40.71 
 
 		 265 aa  89.7  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  46.3 
 
 		 272 aa  89.7  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  45.1 
 
 		 145 aa  89.7  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  43.48 
 
 		 147 aa  89.4  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  35.58 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  35.58 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  38.46 
 
 		 240 aa  88.6  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  34.29 
 
 		 150 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  39.71 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  40 
 
 		 160 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  35.58 
 
 		 235 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1164  hypothetical protein  40 
 
 		 245 aa  87  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  42.86 
 
 		 162 aa  86.7  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  39.26 
 
 		 244 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  39.26 
 
 		 244 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  39.26 
 
 		 244 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  39.26 
 
 		 244 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  39.26 
 
 		 244 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  37.24 
 
 		 248 aa  85.9  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  34.81 
 
 		 238 aa  85.5  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  41.84 
 
 		 160 aa  85.5  9e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3151  hypothetical protein  39.86 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  36.44 
 
 		 176 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  38.52 
 
 		 244 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  36.11 
 
 		 160 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  44.55 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  41.61 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  35.71 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  35.25 
 
 		 165 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  39.67 
 
 		 160 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  36.51 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1412  hypothetical protein  38.52 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  35.04 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  35.26 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  37.5 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2686  hypothetical protein  32.26 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.468068  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  35.04 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  39.86 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0423  hypothetical protein  42.34 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.237616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  35.04 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>