208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0512 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  307  4e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  65.96 
 
 
143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  65.96 
 
 
143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  51.45 
 
 
145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  54.2 
 
 
138 aa  149  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  48.32 
 
 
311 aa  146  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  54.89 
 
 
162 aa  144  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  50.36 
 
 
150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  49.65 
 
 
162 aa  140  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  50.77 
 
 
145 aa  135  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  47.92 
 
 
167 aa  134  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  48.85 
 
 
165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  50.76 
 
 
151 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  47.33 
 
 
167 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  47.33 
 
 
168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  47.33 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  45.99 
 
 
166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  42.36 
 
 
164 aa  124  6e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  45.07 
 
 
183 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  39.73 
 
 
181 aa  120  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  43.57 
 
 
175 aa  120  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  53.39 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  42.76 
 
 
155 aa  118  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  51.69 
 
 
163 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  50.42 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  41.84 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  41.1 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  41.5 
 
 
161 aa  114  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  42.75 
 
 
141 aa  115  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  39.72 
 
 
183 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  40.13 
 
 
182 aa  114  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  53.39 
 
 
153 aa  114  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  42.64 
 
 
173 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  50 
 
 
176 aa  113  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  42.86 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  41.48 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  38.41 
 
 
172 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  42.14 
 
 
166 aa  111  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  47.46 
 
 
164 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  43.75 
 
 
131 aa  110  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  38.1 
 
 
135 aa  110  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  44.12 
 
 
294 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  45.67 
 
 
138 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  48.74 
 
 
153 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  43.22 
 
 
163 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  43.57 
 
 
166 aa  104  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  46.67 
 
 
163 aa  104  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  45.16 
 
 
140 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  38.46 
 
 
164 aa  103  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  45.16 
 
 
138 aa  103  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  40.14 
 
 
155 aa  103  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  45.76 
 
 
182 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  39.16 
 
 
161 aa  102  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  43.51 
 
 
271 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  39.72 
 
 
205 aa  101  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  44.35 
 
 
140 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  44.92 
 
 
153 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  35.1 
 
 
196 aa  100  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  35.1 
 
 
172 aa  100  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  44.54 
 
 
145 aa  100  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  41.67 
 
 
166 aa  99.8  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  40.41 
 
 
167 aa  98.6  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  40.8 
 
 
144 aa  99  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  41.67 
 
 
167 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  44.2 
 
 
272 aa  98.6  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  43.51 
 
 
265 aa  96.3  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  44.92 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  43.22 
 
 
153 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  40.74 
 
 
145 aa  94.7  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  38.46 
 
 
171 aa  94.4  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  41.01 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  41.33 
 
 
241 aa  92  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  39.23 
 
 
129 aa  90.9  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  37.6 
 
 
324 aa  90.1  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  40.16 
 
 
323 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 
231 aa  88.6  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  46.02 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  43.7 
 
 
162 aa  88.2  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  42.2 
 
 
133 aa  87.4  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  39.31 
 
 
142 aa  87.4  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  43.85 
 
 
385 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  38.16 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  36 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  33.79 
 
 
232 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  42.86 
 
 
124 aa  84.7  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  36.31 
 
 
251 aa  84.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  36.18 
 
 
240 aa  84.3  6e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  38.35 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  35.33 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  36.97 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  35.33 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  34.42 
 
 
238 aa  82  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  37.16 
 
 
160 aa  82  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  34.53 
 
 
235 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  35 
 
 
240 aa  82  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  32.93 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  42.62 
 
 
332 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  37.68 
 
 
231 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.675197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>