208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1275 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  323  7e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  87.5 
 
 		 160 aa  288  2e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  79.5 
 
 		 162 aa  263  5e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0423  hypothetical protein  85.21 
 
 		 158 aa  246  8e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.237616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  74.36 
 
 		 160 aa  244  4e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  40.29 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  38.13 
 
 		 153 aa  103  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  37.41 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  42.86 
 
 		 133 aa  96.7  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  36.99 
 
 		 160 aa  96.3  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  42.11 
 
 		 142 aa  92.8  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  44.34 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  44 
 
 		 147 aa  91.7  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  35.62 
 
 		 180 aa  90.1  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  37.58 
 
 		 182 aa  89.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  34.32 
 
 		 182 aa  88.6  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  38.1 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 		 294 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  41.67 
 
 		 181 aa  87  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  40.5 
 
 		 139 aa  87.4  8e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  38.89 
 
 		 147 aa  87  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  39.57 
 
 		 139 aa  86.3  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  40.48 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  38.46 
 
 		 265 aa  85.1  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  36.3 
 
 		 271 aa  85.1  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  40.2 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  35.33 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  40.2 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  39.22 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  40.2 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  35.2 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  42.31 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  39.22 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  35.48 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  39.85 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  39.53 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  38.24 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  38.24 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  39.68 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  38.24 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  37.8 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  33.86 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  39.58 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  39.58 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  36.29 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  33.96 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2252  hypothetical protein  37.25 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.89628e-27 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0302  hypothetical protein  36.67 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  38.46 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  38.21 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  37.78 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  32.68 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  36.29 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  37.72 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  39.58 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  41.53 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3420  hypothetical protein  35.81 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82049  normal  0.0336552 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  33.08 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0449  hypothetical protein  38.61 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3476  protein of unknown function UPF0066  31.54 
 
 		 283 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  33.61 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  33.08 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2599  protein of unknown function UPF0066  38.89 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273401  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  41.3 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  36.45 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  39.58 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  42.39 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  32.89 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  34.15 
 
 		 272 aa  72  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  33.87 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  32.19 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  40.22 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  37.62 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  39.42 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  36.62 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  35.05 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  39.13 
 
 		 232 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  39.13 
 
 		 230 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  36.84 
 
 		 205 aa  70.5  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  39.13 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  38.04 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3133  putative transcriptional regulator  34.23 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1471  hypothetical protein  32.77 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  37.06 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  39.6 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  35.77 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  38.76 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  38.37 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0388  hypothetical protein  33.66 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  38.3 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1303  protein of unknown function UPF0066  35.42 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4335  putative transcriptional regulator  37.01 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  36.29 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0535  hypothetical protein  33.79 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  38.04 
 
 		 240 aa  67.4  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  37.76 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  40.21 
 
 		 161 aa  67  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  32.19 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  33.86 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>