208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0258 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  334  3.9999999999999995e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  56.86 
 
 		 166 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  51.61 
 
 		 167 aa  180  9.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  44.76 
 
 		 181 aa  148  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  50 
 
 		 183 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  46.9 
 
 		 155 aa  137  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  42.76 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  47.01 
 
 		 294 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  45.45 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  45.07 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  43.95 
 
 		 175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  40.74 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  42.45 
 
 		 143 aa  124  7e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  42.45 
 
 		 143 aa  124  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  47.48 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  42.28 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  42.45 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  42.38 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  46.04 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  41.1 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  42.25 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  41.1 
 
 		 232 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  43.57 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  40.97 
 
 		 231 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  40.97 
 
 		 230 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  36.99 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  40.28 
 
 		 230 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  47.76 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  47.01 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  36.9 
 
 		 235 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  42.07 
 
 		 231 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  41.01 
 
 		 240 aa  102  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  38.3 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  39.74 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  40.97 
 
 		 231 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  36.84 
 
 		 239 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  38.41 
 
 		 234 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  37.04 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  38.1 
 
 		 251 aa  95.9  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  37.76 
 
 		 230 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  36.42 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1164  hypothetical protein  41.45 
 
 		 245 aa  95.5  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  35.33 
 
 		 196 aa  95.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  34.64 
 
 		 172 aa  95.1  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  40.85 
 
 		 262 aa  94.7  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  35.26 
 
 		 182 aa  94.4  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  34.27 
 
 		 150 aa  94  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  38.99 
 
 		 237 aa  93.6  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  36.36 
 
 		 138 aa  92.8  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  37.86 
 
 		 139 aa  91.7  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  42.07 
 
 		 256 aa  91.7  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  33.8 
 
 		 205 aa  90.9  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  38.78 
 
 		 240 aa  90.9  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  40.14 
 
 		 244 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2686  hypothetical protein  36.77 
 
 		 249 aa  89.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.468068  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2589  hypothetical protein  41.26 
 
 		 245 aa  89.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  39.49 
 
 		 228 aa  89.4  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  35.85 
 
 		 239 aa  89  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  42.06 
 
 		 165 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  37.14 
 
 		 139 aa  88.2  5e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  38.26 
 
 		 241 aa  87.8  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  40.41 
 
 		 233 aa  87.8  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  40.14 
 
 		 244 aa  87.4  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  37.67 
 
 		 265 aa  87  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  40.14 
 
 		 244 aa  87  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1412  hypothetical protein  39.44 
 
 		 244 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  40.14 
 
 		 244 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  36.51 
 
 		 271 aa  86.3  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  40.14 
 
 		 244 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3151  hypothetical protein  39.44 
 
 		 244 aa  86.3  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  40.14 
 
 		 244 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  35.29 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  85.5  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  38.03 
 
 		 251 aa  84.3  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  35.34 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  39.44 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  35.54 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  37.6 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  34 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  34.59 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  30.47 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  37.3 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  31.79 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  31.79 
 
 		 246 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  31.79 
 
 		 246 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  38.67 
 
 		 241 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  31.79 
 
 		 246 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  31.79 
 
 		 246 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  35.65 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  29.53 
 
 		 265 aa  81.3  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  36.8 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  32.86 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  33.56 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  35.29 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002726  hypothetical protein  35.22 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0430932  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  32.47 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  41.67 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  31.17 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  31.17 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>