207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00193 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  485  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  485  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  99.57 
 
 
235 aa  483  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  99.57 
 
 
235 aa  483  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  99.15 
 
 
235 aa  481  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  99.15 
 
 
235 aa  481  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  99.57 
 
 
235 aa  483  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  99.15 
 
 
235 aa  481  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  98.72 
 
 
235 aa  479  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  88.94 
 
 
246 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  88.94 
 
 
246 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  88.94 
 
 
246 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  88.94 
 
 
246 aa  434  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  88.94 
 
 
235 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  83.83 
 
 
235 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  71.06 
 
 
235 aa  351  5.9999999999999994e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  71.06 
 
 
235 aa  351  5.9999999999999994e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  71.06 
 
 
235 aa  350  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  70.64 
 
 
235 aa  350  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  71.24 
 
 
235 aa  348  5e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  70.09 
 
 
238 aa  347  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  69.23 
 
 
238 aa  343  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0874  protein of unknown function UPF0066  67.38 
 
 
235 aa  338  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  52.27 
 
 
248 aa  265  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  53.57 
 
 
240 aa  258  6e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  55.36 
 
 
241 aa  256  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  52.99 
 
 
238 aa  256  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  51.28 
 
 
256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03251  hypothetical protein  53.45 
 
 
231 aa  248  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0891  hypothetical protein  51.95 
 
 
232 aa  248  5e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0401  hypothetical protein  52.81 
 
 
231 aa  248  8e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000112089  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002726  hypothetical protein  53.02 
 
 
234 aa  247  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0430932  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2589  hypothetical protein  49.78 
 
 
245 aa  241  6e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  49.78 
 
 
251 aa  241  7e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  49.15 
 
 
265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  48.29 
 
 
262 aa  237  9e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1164  hypothetical protein  47.68 
 
 
245 aa  237  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  50.67 
 
 
240 aa  236  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3151  hypothetical protein  48.95 
 
 
244 aa  234  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  50.23 
 
 
244 aa  231  6e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  50.23 
 
 
244 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1412  hypothetical protein  50.45 
 
 
244 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  50.45 
 
 
244 aa  229  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  50.45 
 
 
244 aa  230  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  50.45 
 
 
244 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  48.67 
 
 
237 aa  228  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  49.77 
 
 
244 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  49.77 
 
 
244 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2686  hypothetical protein  46.08 
 
 
249 aa  222  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.468068  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  41.35 
 
 
239 aa  212  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  51.34 
 
 
251 aa  208  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02964  hypothetical protein  41.81 
 
 
239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  47.95 
 
 
235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  44.05 
 
 
241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  49.3 
 
 
230 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  48.83 
 
 
231 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  48.36 
 
 
231 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  49.07 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  48.6 
 
 
232 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  46.22 
 
 
230 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  47.49 
 
 
240 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  45.37 
 
 
239 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  49.3 
 
 
231 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  45.21 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  41.56 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  41.55 
 
 
233 aa  181  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  38.66 
 
 
231 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  39.47 
 
 
233 aa  168  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1534  hypothetical protein  33.72 
 
 
280 aa  154  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0746722  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1915  hypothetical protein  38.98 
 
 
263 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000031787  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0888  hypothetical protein  34.87 
 
 
280 aa  149  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.346736  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  40.65 
 
 
196 aa  118  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  40.65 
 
 
172 aa  118  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  39.63 
 
 
182 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  38.85 
 
 
172 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10437  predicted protein  44.06 
 
 
142 aa  105  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39681  predicted protein  35.93 
 
 
336 aa  103  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0134522  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31759  predicted protein  29.84 
 
 
286 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330463  normal  0.0179546 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  38.27 
 
 
183 aa  99  6e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  37.5 
 
 
145 aa  95.9  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  35.85 
 
 
155 aa  95.9  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  40.88 
 
 
164 aa  95.5  6e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  36.24 
 
 
166 aa  90.1  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  34.19 
 
 
164 aa  89.7  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  37.86 
 
 
167 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  36.73 
 
 
175 aa  88.2  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  39.39 
 
 
160 aa  87  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  37.41 
 
 
161 aa  86.3  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  32.26 
 
 
167 aa  85.9  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  32.48 
 
 
181 aa  84  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  37.23 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  32.91 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  31.58 
 
 
183 aa  82  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  32.67 
 
 
166 aa  82  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  33.77 
 
 
166 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  34.31 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  46.32 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  31.17 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  31.01 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  36.6 
 
 
143 aa  77  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>