208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6838 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  100 
 
 		 151 aa  310  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3420  hypothetical protein  69.39 
 
 		 159 aa  223  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82049  normal  0.0336552 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2421  hypothetical protein  59.33 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0302  hypothetical protein  55.7 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  52.32 
 
 		 157 aa  175  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  50.33 
 
 		 157 aa  174  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  50.99 
 
 		 157 aa  174  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  51.66 
 
 		 157 aa  174  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  51.66 
 
 		 157 aa  173  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  50.99 
 
 		 157 aa  173  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  50.99 
 
 		 157 aa  173  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  51.66 
 
 		 157 aa  173  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  50.99 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  51.01 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4335  putative transcriptional regulator  56.46 
 
 		 156 aa  168  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2252  hypothetical protein  49.67 
 
 		 157 aa  167  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.89628e-27 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  50.34 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  50.34 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1303  protein of unknown function UPF0066  46.67 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3133  putative transcriptional regulator  44.97 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  34.87 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  40.37 
 
 		 182 aa  94.4  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  42.99 
 
 		 182 aa  92  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  41.79 
 
 		 265 aa  91.3  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  41.59 
 
 		 182 aa  89.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  36.59 
 
 		 180 aa  85.9  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  44.23 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  34.53 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  36.11 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  32.39 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  41.18 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  33.09 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  41.67 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  40.91 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  48.39 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  36.59 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  34.38 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  42.27 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  36.67 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  38.21 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  40.2 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  39.22 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  33.77 
 
 		 321 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  38.41 
 
 		 251 aa  74.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  41.41 
 
 		 239 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  39.78 
 
 		 160 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  35.25 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  44.21 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  34.38 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  42.86 
 
 		 230 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  37.61 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  36.72 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  34.86 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  37.17 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0423  hypothetical protein  35.77 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.237616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0535  hypothetical protein  37.29 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39681  predicted protein  36.76 
 
 		 336 aa  71.6  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0134522  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  37.61 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  39 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  40.57 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  39.36 
 
 		 235 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  41.49 
 
 		 294 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  35.38 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  42.55 
 
 		 231 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  42.86 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  36.27 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  40.43 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  42.86 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3831  protein of unknown function UPF0066  31.09 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  39.39 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  42.86 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3476  protein of unknown function UPF0066  33.82 
 
 		 283 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  35.48 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  41.23 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  41.49 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  45.65 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  41.76 
 
 		 230 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  45.45 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  34.25 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  36.11 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  33.96 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  37.6 
 
 		 173 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  38.68 
 
 		 240 aa  67  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  39.25 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  37.89 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  38.46 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  39.36 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  40.43 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  38.53 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  38.03 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  38.53 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  39.36 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  35.14 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10437  predicted protein  38.26 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  42.16 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  30.26 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  39.13 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>