208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0024 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  100 
 
 
135 aa  276  7e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  42.97 
 
 
164 aa  120  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  42.62 
 
 
138 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  47.11 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  45.08 
 
 
160 aa  113  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  41.41 
 
 
183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  38.1 
 
 
151 aa  110  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  42.54 
 
 
240 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  42.96 
 
 
172 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  41.79 
 
 
234 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  38.58 
 
 
294 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  45 
 
 
145 aa  106  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  42.22 
 
 
196 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  39.55 
 
 
235 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  45.38 
 
 
172 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  41.13 
 
 
143 aa  105  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  41.13 
 
 
143 aa  105  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  41.27 
 
 
175 aa  105  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  40.32 
 
 
167 aa  104  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  40.48 
 
 
166 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  42.74 
 
 
162 aa  105  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  40 
 
 
239 aa  103  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  40.58 
 
 
230 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  40.3 
 
 
231 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  39.69 
 
 
129 aa  103  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  38.52 
 
 
183 aa  102  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  43.85 
 
 
182 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  43.65 
 
 
144 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  40.3 
 
 
232 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  38.28 
 
 
155 aa  101  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  41.27 
 
 
164 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  39.55 
 
 
230 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  41.67 
 
 
142 aa  100  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  40 
 
 
311 aa  100  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  40.3 
 
 
230 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  41.3 
 
 
231 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  40.32 
 
 
150 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  40.58 
 
 
231 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  40.32 
 
 
139 aa  98.6  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  40.6 
 
 
145 aa  97.4  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  40.98 
 
 
166 aa  96.3  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  38.28 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  38.52 
 
 
161 aa  95.5  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  41.32 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  40.65 
 
 
142 aa  94  6e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  38.66 
 
 
164 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  38.4 
 
 
131 aa  92.8  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  37.21 
 
 
167 aa  92.8  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  40.58 
 
 
237 aa  92  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  40.62 
 
 
271 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  39.42 
 
 
238 aa  90.1  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  39.69 
 
 
265 aa  90.1  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  35.43 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  40.16 
 
 
167 aa  89.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  38.28 
 
 
161 aa  89  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  32.28 
 
 
171 aa  87.8  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  38.4 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0891  hypothetical protein  36.96 
 
 
232 aa  87.4  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  44.55 
 
 
162 aa  87.4  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  36.13 
 
 
182 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  39.13 
 
 
233 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  38.4 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0401  hypothetical protein  38.81 
 
 
231 aa  86.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000112089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  36.09 
 
 
162 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  34.38 
 
 
181 aa  85.9  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  36.8 
 
 
166 aa  85.5  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  31.45 
 
 
166 aa  84.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  36.13 
 
 
153 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  35.77 
 
 
251 aa  83.6  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  31.09 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  35.61 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  31.67 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002726  hypothetical protein  36.57 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0430932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  36.72 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  32.77 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  36.72 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  40.46 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  41.91 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  30.47 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  32.77 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  36.97 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  35.07 
 
 
241 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  37.88 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  37.98 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  37.04 
 
 
251 aa  81.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  31.82 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03251  hypothetical protein  35.82 
 
 
231 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  36.72 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  35.29 
 
 
241 aa  81.3  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  35.94 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  35.94 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  32.77 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  35.11 
 
 
332 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  34.33 
 
 
256 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  31.4 
 
 
162 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  33.07 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  35.94 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  33.07 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>