207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1908 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  265  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  45.9 
 
 		 332 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  44.8 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  45.08 
 
 		 138 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  50.39 
 
 		 311 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  45.8 
 
 		 385 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  43.2 
 
 		 138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  43.44 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  41.8 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  43.75 
 
 		 151 aa  110  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  43.2 
 
 		 140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  39.84 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  40 
 
 		 323 aa  107  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  41.94 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  41.94 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  45.6 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  43.44 
 
 		 167 aa  103  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  40.16 
 
 		 332 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  38.33 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  41.18 
 
 		 324 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  41.6 
 
 		 173 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  41.46 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0839  hypothetical protein  45.45 
 
 		 123 aa  98.2  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000606152  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  42.02 
 
 		 168 aa  95.9  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  41.6 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  44.44 
 
 		 171 aa  94.4  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  42.02 
 
 		 178 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  38.4 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  44.54 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  39.84 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  43.7 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  41.46 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  42.86 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  40.91 
 
 		 145 aa  92  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  43.7 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  42.02 
 
 		 153 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  37.7 
 
 		 162 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  43.2 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  42.86 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  42.02 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  37.7 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  39.52 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0388  hypothetical protein  44.33 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  39.68 
 
 		 166 aa  87.8  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  38.4 
 
 		 165 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1471  hypothetical protein  41.67 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  36.64 
 
 		 271 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  42.86 
 
 		 174 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  41.13 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  43.7 
 
 		 163 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  38.58 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0449  hypothetical protein  41.24 
 
 		 127 aa  84.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  41.18 
 
 		 182 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  37.86 
 
 		 172 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  40.16 
 
 		 182 aa  84.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0517  hypothetical protein  40.57 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  37.86 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  37.88 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  37.8 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  37.19 
 
 		 183 aa  80.5  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  33.6 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  37.6 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  37.59 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  39.06 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  35.38 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  37.12 
 
 		 172 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  35.94 
 
 		 272 aa  77  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  37.12 
 
 		 196 aa  77  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  36.59 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  35.48 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  41.22 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  33.57 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  34.4 
 
 		 265 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  36.3 
 
 		 235 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  38.1 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  32.28 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  33.07 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  33.08 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  38.71 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  31.15 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  31.09 
 
 		 163 aa  73.6  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  34.92 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  34.86 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  34.65 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  34.85 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  33.85 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  36.43 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  37.6 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  32.79 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  30.71 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  34.96 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  36.76 
 
 		 230 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  36.03 
 
 		 231 aa  70.1  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  36.03 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  32.98 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  30.65 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3420  hypothetical protein  38.64 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82049  normal  0.0336552 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  34.15 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  38.24 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  36.84 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>