207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0464 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  349  1e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  52.63 
 
 
182 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  50.29 
 
 
182 aa  189  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  47.56 
 
 
182 aa  177  9e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  48.5 
 
 
180 aa  174  8e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  43.65 
 
 
153 aa  98.2  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  42.11 
 
 
147 aa  96.3  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  43.81 
 
 
147 aa  95.5  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  44.34 
 
 
150 aa  95.1  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  51.46 
 
 
145 aa  95.1  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  35.71 
 
 
157 aa  93.6  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  40.87 
 
 
154 aa  93.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  40.91 
 
 
153 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  35.71 
 
 
157 aa  92  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  35 
 
 
157 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  35.71 
 
 
157 aa  91.3  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  35 
 
 
157 aa  90.9  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  35 
 
 
157 aa  90.9  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  42.31 
 
 
147 aa  91.3  7e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  37.4 
 
 
159 aa  90.9  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  38.18 
 
 
157 aa  90.5  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  34.29 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  45.83 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0302  hypothetical protein  38.06 
 
 
155 aa  87.8  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  39.04 
 
 
144 aa  87.4  9e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2252  hypothetical protein  35 
 
 
157 aa  87.4  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.89628e-27 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  34.71 
 
 
152 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  34.55 
 
 
157 aa  85.1  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  34.15 
 
 
160 aa  84.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  37.5 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1303  protein of unknown function UPF0066  39.84 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  41.94 
 
 
142 aa  80.5  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  40.91 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  42.99 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  37.98 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  38.46 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3133  putative transcriptional regulator  37.4 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  40.68 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  37.84 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3420  hypothetical protein  35.77 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82049  normal  0.0336552 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  43.81 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  32.54 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  42.37 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  43.86 
 
 
332 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  37.98 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  34.25 
 
 
311 aa  73.9  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  36.81 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  39.52 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0535  hypothetical protein  39.42 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  39.05 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  37.8 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  41.12 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  41.41 
 
 
244 aa  72  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  41.41 
 
 
244 aa  72  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  36.21 
 
 
160 aa  72  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0423  hypothetical protein  37.84 
 
 
158 aa  72  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.237616  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  41.41 
 
 
244 aa  72  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  41.41 
 
 
244 aa  72  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  37.19 
 
 
244 aa  72  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3151  hypothetical protein  41.41 
 
 
244 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  41.41 
 
 
244 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  41.41 
 
 
244 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  45.45 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  45.45 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  32.17 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  40.35 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  37.17 
 
 
145 aa  70.5  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  31.03 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  40.38 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  32.39 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3476  protein of unknown function UPF0066  34.29 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  38.83 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  37.39 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  30 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  37.17 
 
 
321 aa  68.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  41.86 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1412  hypothetical protein  40.4 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  31.47 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  38.38 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1164  hypothetical protein  41.3 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  39.05 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0388  hypothetical protein  35.96 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2589  hypothetical protein  38.38 
 
 
245 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  39.39 
 
 
256 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  30.32 
 
 
234 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  32.87 
 
 
239 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  30.46 
 
 
238 aa  67.4  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  30.82 
 
 
240 aa  67.4  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  39.39 
 
 
240 aa  67  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  32.41 
 
 
138 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  41 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  33.1 
 
 
140 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  38.38 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1471  hypothetical protein  37.08 
 
 
127 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0449  hypothetical protein  38.2 
 
 
127 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160137  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  32.87 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  40.38 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  32.17 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  44.44 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>