More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1965 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 
385 aa  765    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  59.15 
 
 
332 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  56 
 
 
332 aa  378  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  42.43 
 
 
324 aa  264  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  38.4 
 
 
323 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0068  class II aldolase/adducin family protein  54.4 
 
 
213 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  55.12 
 
 
138 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  55.91 
 
 
138 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  54.96 
 
 
140 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  53.44 
 
 
140 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  48.85 
 
 
131 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  45.8 
 
 
131 aa  113  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  43.08 
 
 
144 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  36.9 
 
 
189 aa  102  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  37.7 
 
 
207 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  33.7 
 
 
181 aa  101  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4065  class II aldolase/adducin-like  36.52 
 
 
235 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  38.12 
 
 
215 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  38.22 
 
 
226 aa  93.2  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  34.24 
 
 
219 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4213  class II aldolase/adducin family protein  39.18 
 
 
235 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511631  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  47.2 
 
 
145 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  38.24 
 
 
208 aa  90.9  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  38.24 
 
 
208 aa  90.9  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  35.64 
 
 
243 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  35.86 
 
 
231 aa  91.3  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  44.09 
 
 
143 aa  90.5  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  30.16 
 
 
214 aa  90.9  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  32.79 
 
 
234 aa  90.5  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  44.09 
 
 
143 aa  90.5  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4188  class II aldolase/adducin family protein  36.47 
 
 
235 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  30.11 
 
 
180 aa  89.4  9e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  30.64 
 
 
190 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1697  class II aldolase/adducin family protein  32.6 
 
 
188 aa  89  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  30.46 
 
 
303 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  43.85 
 
 
151 aa  87.4  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0839  hypothetical protein  38.32 
 
 
123 aa  86.3  7e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000606152  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  42.97 
 
 
151 aa  86.7  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  31.21 
 
 
181 aa  86.3  8e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  35.2 
 
 
220 aa  86.3  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3134  L-fuculose phosphate aldolase  34.43 
 
 
215 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248467 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  36.21 
 
 
225 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1471  hypothetical protein  37.17 
 
 
127 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  32.39 
 
 
265 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  32.62 
 
 
222 aa  85.5  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  40.77 
 
 
182 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  34.43 
 
 
215 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  34.43 
 
 
215 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  34.43 
 
 
215 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  34.43 
 
 
215 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  37.78 
 
 
204 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  38.4 
 
 
141 aa  84.7  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0388  hypothetical protein  35.78 
 
 
127 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  35.67 
 
 
168 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  35.71 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  28.18 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  32.22 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  33.33 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0449  hypothetical protein  38.46 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160137  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  35.2 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  34.25 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  36.31 
 
 
178 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  33.33 
 
 
215 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  35.91 
 
 
216 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2940  L-fuculose phosphate aldolase  33.33 
 
 
215 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0887911  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  33.33 
 
 
215 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  33.33 
 
 
215 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  36.96 
 
 
215 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0814  class II aldolase/adducin family protein  32.39 
 
 
192 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.537097  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  35.67 
 
 
167 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0424  class II aldolase/adducin family protein  34.12 
 
 
222 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.130241  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2271  class II aldolase/adducin-like  37.63 
 
 
197 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.453989  hitchhiker  0.000307852 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  35.75 
 
 
224 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  32 
 
 
210 aa  82  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  32.18 
 
 
212 aa  81.6  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  33.33 
 
 
210 aa  81.6  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0939  class II aldolase/adducin family protein  32.02 
 
 
185 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.100017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  34.64 
 
 
228 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  34.59 
 
 
222 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0929  class II aldolase/adducin family protein  32.78 
 
 
239 aa  81.6  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  37.89 
 
 
165 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0362  class II aldolase/adducin family protein  41.21 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0763324  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  35.12 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  35.12 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  39.55 
 
 
162 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  35.2 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  37.78 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  34.25 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1025  L-fuculose-phosphate aldolase  35.03 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  34.41 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  34.41 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  34.41 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2364  L-fuculose phosphate aldolase (class II)  35.03 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  34.41 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3750  L-fuculose-phosphate aldolase  34 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  33.89 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  34.41 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  34.41 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  34.41 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  34.39 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>