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for query gene Rfer_3750 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3750  L-fuculose-phosphate aldolase  100 
 
 		 227 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4772  L-fuculose-phosphate aldolase  59.11 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5239  L-fuculose-phosphate aldolase  59.11 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0359  class II aldolase/adducin-like  56.34 
 
 		 221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_5314  L-fuculose-phosphate aldolase  57.35 
 
 		 215 aa  241  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521984  normal  0.999315 
 
 
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NC_007298  Daro_3336  class II aldolase/adducin, N-terminal  56.59 
 
 		 209 aa  239  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2791  L-fuculose-phosphate aldolase  52.29 
 
 		 223 aa  228  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2778  L-fuculose-phosphate aldolase  56.8 
 
 		 208 aa  227  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008786  Veis_2019  L-fuculose-phosphate aldolase  52.7 
 
 		 236 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
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NC_007493  RSP_2364  L-fuculose phosphate aldolase (class II)  55.03 
 
 		 218 aa  222  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1025  L-fuculose-phosphate aldolase  55.03 
 
 		 218 aa  222  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  48.58 
 
 		 225 aa  221  8e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011901  Tgr7_1228  putative L-fuculose phosphate aldolase  51.67 
 
 		 224 aa  221  9e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642951  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_0476  L-fuculose-phosphate aldolase  52.86 
 
 		 214 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2128  L-fuculose-phosphate aldolase  52.86 
 
 		 214 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  52.91 
 
 		 220 aa  211  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1036  class II aldolase/adducin family protein  52.6 
 
 		 201 aa  211  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_2398  L-fuculose-phosphate aldolase  50.48 
 
 		 214 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.064801  normal  0.908547 
 
 
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NC_011666  Msil_1122  class II aldolase/adducin family protein  50 
 
 		 221 aa  205  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.404632 
 
 
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NC_009620  Smed_3633  L-fuculose-phosphate aldolase  49.52 
 
 		 238 aa  205  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3293  class II aldolase/adducin family protein  49.54 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178192  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_2248  class II aldolase/adducin family protein  50.7 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.589142  normal  0.160982 
 
 
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NC_009485  BBta_3232  L-fuculose-1-phosphate aldolase  46.48 
 
 		 249 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4174  L-fuculose-phosphate aldolase  44.44 
 
 		 218 aa  202  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_2573  L-fuculose-phosphate aldolase  47.39 
 
 		 222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_5136  L-fuculose-phosphate aldolase  45.5 
 
 		 228 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_4810  class II aldolase/adducin family protein  46.26 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.86803  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_2684  class II aldolase/adducin family protein  46.73 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  0.449845 
 
 
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NC_009636  Smed_2157  class II aldolase/adducin family protein  43.87 
 
 		 222 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257803  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  44.5 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  44.02 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_0888  L-fuculose phosphate aldolase  44.02 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  44.02 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  44.02 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2494  L-fuculose-phosphate aldolase  40.76 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  39.05 
 
 		 213 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2940  L-fuculose phosphate aldolase  43.54 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0887911  normal  1 
 
 
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NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  40.1 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A3134  L-fuculose phosphate aldolase  42.58 
 
 		 215 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248467 
 
 
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NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  42.58 
 
 		 215 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  42.58 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  42.58 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  42.58 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal  1 
 
 
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NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  43.48 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  40.28 
 
 		 214 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_3550  class II aldolase/adducin family protein  40 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  40.39 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  40.85 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014150  Bmur_2482  class II aldolase/adducin family protein  33.79 
 
 		 221 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000186834  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  40.95 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0395  L-fuculose phosphate aldolase  36.67 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  38.14 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4923  L-fuculose phosphate aldolase  36.67 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191657  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_0040  class II aldolase/adducin family protein  38.65 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104047  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0333  L-fuculose phosphate aldolase  36.19 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.618561  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0317  L-fuculose phosphate aldolase  36.19 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0320  L-fuculose phosphate aldolase  36.19 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.4164  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0380  L-fuculose phosphate aldolase  36.19 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007530  GBAA_0348  L-fuculose phosphate aldolase  36.19 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0328  L-fuculose phosphate aldolase  35.24 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0442  L-fuculose phosphate aldolase  36.19 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0444  L-fuculose phosphate aldolase  36.19 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4066  class II aldolase/adducin family protein  40.65 
 
 		 216 aa  144  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E3072  L-fuculose phosphate aldolase  50.35 
 
 		 152 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0460293  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  40 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  41.15 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_0523  L-fuculose-phosphate aldolase  37.25 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  34.76 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  38.39 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2268  class II aldolase/adducin family protein  38.34 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.043365 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  36.73 
 
 		 211 aa  118  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  34.45 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  36 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  30.5 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  35.23 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2784  class II aldolase/adducin family protein  36.28 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.86 
 
 		 214 aa  108  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1149  class II aldolase/adducin family protein  31.28 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  40.72 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3562  L-fuculose-phosphate aldolase  37.63 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.272655  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10741  L-fuculose-phosphate aldolase  34.78 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.4342 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  31.16 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  34.72 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  33 
 
 		 222 aa  101  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.86 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  31.28 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_1862  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.28 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3663  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  35.63 
 
 		 213 aa  99  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  31.43 
 
 		 222 aa  98.2  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_0402  class II aldolase/adducin family protein  30.59 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  33.66 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
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NC_014211  Ndas_5404  class II aldolase/adducin family protein  35.45 
 
 		 220 aa  95.1  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  34.55 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  31.16 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  35.06 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_6218  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.23 
 
 		 215 aa  91.7  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.948817 
 
 
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NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  29.55 
 
 		 265 aa  91.7  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
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NC_004311  BRA0144  putative aldolase  30.62 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_1019  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.49 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  31.73 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
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