More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4174 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



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Alignment on homolog gene

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4174  L-fuculose-phosphate aldolase  100 
 
 
218 aa  454  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1025  L-fuculose-phosphate aldolase  62.04 
 
 
218 aa  294  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2364  L-fuculose phosphate aldolase (class II)  62.04 
 
 
218 aa  294  7e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0476  L-fuculose-phosphate aldolase  60.1 
 
 
214 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2128  L-fuculose-phosphate aldolase  60.1 
 
 
214 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5136  L-fuculose-phosphate aldolase  57.08 
 
 
228 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2398  L-fuculose-phosphate aldolase  57.64 
 
 
214 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.064801  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  52.88 
 
 
225 aa  242  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2573  L-fuculose-phosphate aldolase  52.58 
 
 
222 aa  240  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1122  class II aldolase/adducin family protein  53.62 
 
 
221 aa  238  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.404632 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2157  class II aldolase/adducin family protein  53.99 
 
 
222 aa  237  9e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257803  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3633  L-fuculose-phosphate aldolase  51.4 
 
 
238 aa  236  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  50.72 
 
 
220 aa  229  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3232  L-fuculose-1-phosphate aldolase  53.81 
 
 
249 aa  229  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5239  L-fuculose-phosphate aldolase  52.71 
 
 
216 aa  228  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4772  L-fuculose-phosphate aldolase  52.71 
 
 
216 aa  228  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5314  L-fuculose-phosphate aldolase  51.96 
 
 
215 aa  227  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521984  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2791  L-fuculose-phosphate aldolase  50.25 
 
 
223 aa  224  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1036  class II aldolase/adducin family protein  55.38 
 
 
201 aa  224  9e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4810  class II aldolase/adducin family protein  50.24 
 
 
230 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.86803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0888  L-fuculose phosphate aldolase  50 
 
 
215 aa  218  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2940  L-fuculose phosphate aldolase  50.49 
 
 
215 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0887911  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  50 
 
 
215 aa  217  8.999999999999998e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  50 
 
 
215 aa  217  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  50 
 
 
215 aa  217  8.999999999999998e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  50.74 
 
 
215 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  50.74 
 
 
215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  50.74 
 
 
215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  50.74 
 
 
215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal 
 
 
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NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  49.51 
 
 
215 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0359  class II aldolase/adducin-like  48.79 
 
 
221 aa  215  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2778  L-fuculose-phosphate aldolase  51.26 
 
 
208 aa  214  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2019  L-fuculose-phosphate aldolase  48.34 
 
 
236 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2684  class II aldolase/adducin family protein  50.71 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  0.449845 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3134  L-fuculose phosphate aldolase  49.76 
 
 
215 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248467 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  48.29 
 
 
215 aa  209  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2494  L-fuculose-phosphate aldolase  45.63 
 
 
222 aa  209  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3750  L-fuculose-phosphate aldolase  44.44 
 
 
227 aa  202  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1228  putative L-fuculose phosphate aldolase  43.96 
 
 
224 aa  193  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642951  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2248  class II aldolase/adducin family protein  46.83 
 
 
216 aa  191  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.589142  normal  0.160982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3336  class II aldolase/adducin, N-terminal  45.15 
 
 
209 aa  191  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348459 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2482  class II aldolase/adducin family protein  41.46 
 
 
221 aa  189  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000186834  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0523  L-fuculose-phosphate aldolase  45.1 
 
 
231 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3293  class II aldolase/adducin family protein  46.6 
 
 
229 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178192  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  42.33 
 
 
219 aa  170  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  39.61 
 
 
213 aa  167  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3072  L-fuculose phosphate aldolase  53.9 
 
 
152 aa  158  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0460293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0395  L-fuculose phosphate aldolase  38.16 
 
 
213 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0444  L-fuculose phosphate aldolase  38.65 
 
 
213 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0333  L-fuculose phosphate aldolase  38.65 
 
 
213 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.618561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0317  L-fuculose phosphate aldolase  38.65 
 
 
213 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0320  L-fuculose phosphate aldolase  38.65 
 
 
213 aa  156  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.4164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0380  L-fuculose phosphate aldolase  38.65 
 
 
213 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0328  L-fuculose phosphate aldolase  37.68 
 
 
213 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0442  L-fuculose phosphate aldolase  38.65 
 
 
213 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4923  L-fuculose phosphate aldolase  38.16 
 
 
213 aa  155  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191657  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4066  class II aldolase/adducin family protein  39.42 
 
 
216 aa  155  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0348  L-fuculose phosphate aldolase  38.16 
 
 
213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  40 
 
 
216 aa  151  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  37.5 
 
 
214 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  34.62 
 
 
220 aa  148  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3550  class II aldolase/adducin family protein  36.41 
 
 
214 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  35.27 
 
 
237 aa  142  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0040  class II aldolase/adducin family protein  40.12 
 
 
212 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104047  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  35.1 
 
 
212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  35.42 
 
 
215 aa  138  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  36.36 
 
 
215 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2784  class II aldolase/adducin family protein  36.62 
 
 
213 aa  131  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  33.65 
 
 
217 aa  124  9e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2268  class II aldolase/adducin family protein  32.06 
 
 
229 aa  124  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.043365 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  33.68 
 
 
214 aa  122  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  34.57 
 
 
212 aa  119  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5404  class II aldolase/adducin family protein  35.35 
 
 
220 aa  119  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  32.99 
 
 
214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  39.2 
 
 
211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  34.01 
 
 
215 aa  117  9e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  37.57 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10741  L-fuculose-phosphate aldolase  32.84 
 
 
218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.4342 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  29.47 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  38.12 
 
 
189 aa  112  3e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  32.26 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  33.17 
 
 
214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  30 
 
 
219 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3562  L-fuculose-phosphate aldolase  36.48 
 
 
214 aa  107  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.272655  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  32.97 
 
 
222 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0629  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.1 
 
 
212 aa  102  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  33.71 
 
 
212 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_0654  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.13 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  29.5 
 
 
207 aa  98.2  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
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NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  31.28 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
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NC_008346  Swol_0780  L-fuculose phosphate aldolase  41.46 
 
 
220 aa  95.9  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.509551  n/a   
 
 
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NC_008701  Pisl_0939  class II aldolase/adducin family protein  34.27 
 
 
185 aa  95.5  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.100017 
 
 
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NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.22 
 
 
214 aa  94.7  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  31.75 
 
 
303 aa  93.2  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
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NC_013158  Huta_1149  class II aldolase/adducin family protein  26.79 
 
 
215 aa  92.4  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  33.15 
 
 
216 aa  92  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
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NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  28.31 
 
 
234 aa  92  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_06100  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  27.72 
 
 
228 aa  90.9  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.214658  normal 
 
 
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NC_010571  Oter_1302  class II aldolase/adducin family protein  34.27 
 
 
427 aa  91.3  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009376  Pars_0814  class II aldolase/adducin family protein  30.27 
 
 
192 aa  90.1  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.537097  normal 
 
 
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