More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2157 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2157  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 		 222 aa  461  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257803  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_3232  L-fuculose-1-phosphate aldolase  66.67 
 
 		 249 aa  308  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
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NC_009484  Acry_2573  L-fuculose-phosphate aldolase  62.61 
 
 		 222 aa  305  5.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_4810  class II aldolase/adducin family protein  65.09 
 
 		 230 aa  297  8e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.86803  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_2684  class II aldolase/adducin family protein  64.38 
 
 		 224 aa  292  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  0.449845 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4174  L-fuculose-phosphate aldolase  53.99 
 
 		 218 aa  237  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A0359  class II aldolase/adducin-like  54.03 
 
 		 221 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_5136  L-fuculose-phosphate aldolase  52.29 
 
 		 228 aa  231  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1025  L-fuculose-phosphate aldolase  51.4 
 
 		 218 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_2364  L-fuculose phosphate aldolase (class II)  51.4 
 
 		 218 aa  228  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2019  L-fuculose-phosphate aldolase  52.09 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1122  class II aldolase/adducin family protein  52.31 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.404632 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4772  L-fuculose-phosphate aldolase  49.54 
 
 		 216 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5239  L-fuculose-phosphate aldolase  49.54 
 
 		 216 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1036  class II aldolase/adducin family protein  54.23 
 
 		 201 aa  218  7e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  50.71 
 
 		 220 aa  218  7e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2398  L-fuculose-phosphate aldolase  53.05 
 
 		 214 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.064801  normal  0.908547 
 
 
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NC_010725  Mpop_5314  L-fuculose-phosphate aldolase  49.07 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521984  normal  0.999315 
 
 
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NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_0476  L-fuculose-phosphate aldolase  50.7 
 
 		 214 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009620  Smed_3633  L-fuculose-phosphate aldolase  45.21 
 
 		 238 aa  211  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2128  L-fuculose-phosphate aldolase  50.7 
 
 		 214 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2778  L-fuculose-phosphate aldolase  50.76 
 
 		 208 aa  207  9e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2791  L-fuculose-phosphate aldolase  48.82 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_0523  L-fuculose-phosphate aldolase  47.22 
 
 		 231 aa  201  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  47.42 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  47.42 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  47.42 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2940  L-fuculose phosphate aldolase  47.42 
 
 		 215 aa  192  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0887911  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  46.95 
 
 		 215 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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CP001637  EcDH1_0888  L-fuculose phosphate aldolase  46.95 
 
 		 215 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3750  L-fuculose-phosphate aldolase  43.87 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3293  class II aldolase/adducin family protein  46.48 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178192  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  45.54 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  45.54 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  45.54 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  45.07 
 
 		 215 aa  185  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014150  Bmur_2482  class II aldolase/adducin family protein  43.72 
 
 		 221 aa  184  8e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000186834  n/a   
 
 
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NC_014150  Bmur_2494  L-fuculose-phosphate aldolase  44.7 
 
 		 222 aa  184  8e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A3134  L-fuculose phosphate aldolase  45.54 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248467 
 
 
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NC_009719  Plav_2248  class II aldolase/adducin family protein  42.25 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.589142  normal  0.160982 
 
 
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NC_011901  Tgr7_1228  putative L-fuculose phosphate aldolase  43.94 
 
 		 224 aa  181  7e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642951  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_3336  class II aldolase/adducin, N-terminal  42.86 
 
 		 209 aa  181  8.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348459 
 
 
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NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  43.26 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  43.72 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  41.04 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_3550  class II aldolase/adducin family protein  40 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  39.81 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_4066  class II aldolase/adducin family protein  37.21 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  38.21 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  38.57 
 
 		 237 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  39.23 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  39.44 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  39.91 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
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NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  42.86 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0333  L-fuculose phosphate aldolase  38.1 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.618561  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0317  L-fuculose phosphate aldolase  38.1 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0320  L-fuculose phosphate aldolase  38.1 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.4164  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0395  L-fuculose phosphate aldolase  37.62 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0328  L-fuculose phosphate aldolase  37.14 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0380  L-fuculose phosphate aldolase  38.1 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  36.79 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4923  L-fuculose phosphate aldolase  37.14 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0442  L-fuculose phosphate aldolase  37.62 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0444  L-fuculose phosphate aldolase  37.14 
 
 		 213 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0348  L-fuculose phosphate aldolase  37.62 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0040  class II aldolase/adducin family protein  39.23 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104047  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3072  L-fuculose phosphate aldolase  50.35 
 
 		 152 aa  139  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0460293  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2784  class II aldolase/adducin family protein  38.5 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  37.69 
 
 		 215 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  36.74 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10741  L-fuculose-phosphate aldolase  36.27 
 
 		 218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.4342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  37.5 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0629  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  35.89 
 
 		 212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0654  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  35.41 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  36.55 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2268  class II aldolase/adducin family protein  37.24 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.043365 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.92 
 
 		 214 aa  121  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  34.22 
 
 		 212 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  31.71 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  32.99 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  36.82 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1149  class II aldolase/adducin family protein  34.29 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  34.65 
 
 		 222 aa  114  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1656  aminotransferase  36.9 
 
 		 753 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12102  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0780  L-fuculose phosphate aldolase  35.45 
 
 		 220 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.509551  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  34.08 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.19 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  30.66 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
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NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  30.88 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
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NC_013174  Jden_0497  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  33.68 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.591725 
 
 
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NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  31.5 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
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NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  28.77 
 
 		 264 aa  97.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  29.8 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_1862  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  34.43 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  35.58 
 
 		 189 aa  97.1  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_3562  L-fuculose-phosphate aldolase  38 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.272655  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_6218  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.56 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.948817 
 
 
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NC_008541  Arth_0223  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.9 
 
 		 226 aa  95.9  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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