More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5136 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5136  L-fuculose-phosphate aldolase  100 
 
 		 228 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4174  L-fuculose-phosphate aldolase  57.08 
 
 		 218 aa  261  6.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1025  L-fuculose-phosphate aldolase  55.24 
 
 		 218 aa  254  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2364  L-fuculose phosphate aldolase (class II)  54.76 
 
 		 218 aa  252  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  53.74 
 
 		 220 aa  244  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.190003 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0888  L-fuculose phosphate aldolase  55.56 
 
 		 215 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0476  L-fuculose-phosphate aldolase  56.52 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2398  L-fuculose-phosphate aldolase  55.56 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.064801  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2940  L-fuculose phosphate aldolase  55.56 
 
 		 215 aa  243  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0887911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4772  L-fuculose-phosphate aldolase  55.87 
 
 		 216 aa  242  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2128  L-fuculose-phosphate aldolase  56.52 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5239  L-fuculose-phosphate aldolase  55.87 
 
 		 216 aa  242  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  55.56 
 
 		 215 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  55.56 
 
 		 215 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 225 aa  242  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  55.56 
 
 		 215 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  55.07 
 
 		 215 aa  240  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1122  class II aldolase/adducin family protein  54.88 
 
 		 221 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.404632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5314  L-fuculose-phosphate aldolase  54.67 
 
 		 215 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521984  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4810  class II aldolase/adducin family protein  54.63 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.86803  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2573  L-fuculose-phosphate aldolase  50.93 
 
 		 222 aa  233  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2684  class II aldolase/adducin family protein  56.46 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  0.449845 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  54.11 
 
 		 215 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  54.11 
 
 		 215 aa  231  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  54.11 
 
 		 215 aa  231  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  54.11 
 
 		 215 aa  231  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2157  class II aldolase/adducin family protein  52.29 
 
 		 222 aa  231  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3134  L-fuculose phosphate aldolase  54.11 
 
 		 215 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1036  class II aldolase/adducin family protein  55.33 
 
 		 201 aa  229  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2791  L-fuculose-phosphate aldolase  52.53 
 
 		 223 aa  229  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3232  L-fuculose-1-phosphate aldolase  50 
 
 		 249 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0359  class II aldolase/adducin-like  50.93 
 
 		 221 aa  225  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3633  L-fuculose-phosphate aldolase  48.57 
 
 		 238 aa  218  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2019  L-fuculose-phosphate aldolase  49.09 
 
 		 236 aa  213  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2494  L-fuculose-phosphate aldolase  45.79 
 
 		 222 aa  210  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  47.83 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2482  class II aldolase/adducin family protein  45.37 
 
 		 221 aa  203  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000186834  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2778  L-fuculose-phosphate aldolase  48.56 
 
 		 208 aa  202  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3750  L-fuculose-phosphate aldolase  45.5 
 
 		 227 aa  194  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0523  L-fuculose-phosphate aldolase  44.39 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2248  class II aldolase/adducin family protein  46.86 
 
 		 216 aa  188  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.589142  normal  0.160982 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  45.37 
 
 		 219 aa  184  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1228  putative L-fuculose phosphate aldolase  41.4 
 
 		 224 aa  181  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642951  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3336  class II aldolase/adducin, N-terminal  42.44 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348459 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3072  L-fuculose phosphate aldolase  56.46 
 
 		 152 aa  175  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0460293  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3293  class II aldolase/adducin family protein  42.72 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178192  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  35.98 
 
 		 220 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  33.97 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  36.02 
 
 		 237 aa  151  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  35.1 
 
 		 214 aa  148  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0395  L-fuculose phosphate aldolase  36.23 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4923  L-fuculose phosphate aldolase  35.75 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  35.75 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0442  L-fuculose phosphate aldolase  35.75 
 
 		 213 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0333  L-fuculose phosphate aldolase  35.75 
 
 		 213 aa  144  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.618561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0317  L-fuculose phosphate aldolase  35.75 
 
 		 213 aa  144  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0320  L-fuculose phosphate aldolase  35.75 
 
 		 213 aa  144  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.4164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0380  L-fuculose phosphate aldolase  35.75 
 
 		 213 aa  144  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0444  L-fuculose phosphate aldolase  35.27 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0040  class II aldolase/adducin family protein  37.68 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104047  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0328  L-fuculose phosphate aldolase  34.78 
 
 		 213 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  34.3 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3550  class II aldolase/adducin family protein  33.49 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0348  L-fuculose phosphate aldolase  35.27 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  36.62 
 
 		 215 aa  138  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  37.26 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  35.89 
 
 		 217 aa  131  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  37.62 
 
 		 215 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  35.9 
 
 		 211 aa  125  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2268  class II aldolase/adducin family protein  36.68 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.043365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4066  class II aldolase/adducin family protein  33.66 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10741  L-fuculose-phosphate aldolase  34.31 
 
 		 218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.4342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3562  L-fuculose-phosphate aldolase  39.13 
 
 		 214 aa  118  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.272655  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  30.62 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.12 
 
 		 214 aa  114  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  32 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  32.65 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  33.5 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2784  class II aldolase/adducin family protein  33.49 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  32.98 
 
 		 214 aa  109  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  32.54 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0629  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.77 
 
 		 212 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0654  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.29 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0497  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  33.33 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.591725 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  32.12 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  33.89 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  37.42 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  31.34 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1862  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.76 
 
 		 217 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0381  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  32.26 
 
 		 238 aa  101  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  34.62 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1656  aminotransferase  32.8 
 
 		 753 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.47 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  30.81 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5404  class II aldolase/adducin family protein  34.3 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  30.81 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2271  class II aldolase/adducin-like  31.94 
 
 		 197 aa  99.4  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.453989  hitchhiker  0.000307852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0223  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.95 
 
 		 226 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  28.76 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06950  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  33.33 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>