277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3072 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3072  L-fuculose phosphate aldolase  100 
 
 
152 aa  310  3.9999999999999997e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0460293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  100 
 
 
215 aa  303  7e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  100 
 
 
215 aa  303  7e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  100 
 
 
215 aa  303  7e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  100 
 
 
215 aa  303  8.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0888  L-fuculose phosphate aldolase  99.32 
 
 
215 aa  300  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2940  L-fuculose phosphate aldolase  98.64 
 
 
215 aa  297  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0887911  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  93.2 
 
 
215 aa  288  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  93.2 
 
 
215 aa  288  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  93.2 
 
 
215 aa  288  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  93.2 
 
 
215 aa  288  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3134  L-fuculose phosphate aldolase  91.84 
 
 
215 aa  284  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248467 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  63.27 
 
 
215 aa  202  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5136  L-fuculose-phosphate aldolase  56.46 
 
 
228 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  62.41 
 
 
225 aa  173  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2494  L-fuculose-phosphate aldolase  53.06 
 
 
222 aa  165  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  56.74 
 
 
220 aa  164  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2398  L-fuculose-phosphate aldolase  55.56 
 
 
214 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.064801  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4174  L-fuculose-phosphate aldolase  53.9 
 
 
218 aa  158  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0476  L-fuculose-phosphate aldolase  55.56 
 
 
214 aa  157  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2128  L-fuculose-phosphate aldolase  55.56 
 
 
214 aa  157  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1036  class II aldolase/adducin family protein  54.86 
 
 
201 aa  153  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2791  L-fuculose-phosphate aldolase  52.82 
 
 
223 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1025  L-fuculose-phosphate aldolase  51.77 
 
 
218 aa  151  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2364  L-fuculose phosphate aldolase (class II)  51.77 
 
 
218 aa  150  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2019  L-fuculose-phosphate aldolase  52.41 
 
 
236 aa  150  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5239  L-fuculose-phosphate aldolase  53.15 
 
 
216 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4772  L-fuculose-phosphate aldolase  53.15 
 
 
216 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2248  class II aldolase/adducin family protein  55.24 
 
 
216 aa  149  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.589142  normal  0.160982 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1122  class II aldolase/adducin family protein  54.55 
 
 
221 aa  148  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.404632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5314  L-fuculose-phosphate aldolase  51.75 
 
 
215 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521984  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0359  class II aldolase/adducin-like  55.32 
 
 
221 aa  147  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2684  class II aldolase/adducin family protein  51.05 
 
 
224 aa  144  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  0.449845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3232  L-fuculose-1-phosphate aldolase  48.95 
 
 
249 aa  142  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2482  class II aldolase/adducin family protein  44.9 
 
 
221 aa  142  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000186834  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3750  L-fuculose-phosphate aldolase  50.35 
 
 
227 aa  140  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4810  class II aldolase/adducin family protein  48.28 
 
 
230 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.86803  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2157  class II aldolase/adducin family protein  50.35 
 
 
222 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257803  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2573  L-fuculose-phosphate aldolase  45.52 
 
 
222 aa  136  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2778  L-fuculose-phosphate aldolase  49.29 
 
 
208 aa  132  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  45.39 
 
 
213 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3633  L-fuculose-phosphate aldolase  45.45 
 
 
238 aa  133  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  46.1 
 
 
220 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  46.85 
 
 
237 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  45.77 
 
 
214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  43.26 
 
 
215 aa  124  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1228  putative L-fuculose phosphate aldolase  43.84 
 
 
224 aa  124  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642951  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3293  class II aldolase/adducin family protein  47.52 
 
 
229 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178192  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0523  L-fuculose-phosphate aldolase  43.15 
 
 
231 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3336  class II aldolase/adducin, N-terminal  45.39 
 
 
209 aa  120  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348459 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  41.55 
 
 
219 aa  117  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0040  class II aldolase/adducin family protein  41.13 
 
 
212 aa  117  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104047  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2784  class II aldolase/adducin family protein  44.76 
 
 
213 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0395  L-fuculose phosphate aldolase  40.43 
 
 
213 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3550  class II aldolase/adducin family protein  40.97 
 
 
214 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0328  L-fuculose phosphate aldolase  39.72 
 
 
213 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  40.43 
 
 
212 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4923  L-fuculose phosphate aldolase  39.72 
 
 
213 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191657  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0333  L-fuculose phosphate aldolase  40.43 
 
 
213 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.618561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0317  L-fuculose phosphate aldolase  40.43 
 
 
213 aa  111  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0320  L-fuculose phosphate aldolase  40.43 
 
 
213 aa  111  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.4164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0380  L-fuculose phosphate aldolase  40.43 
 
 
213 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0348  L-fuculose phosphate aldolase  40.43 
 
 
213 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0442  L-fuculose phosphate aldolase  40.43 
 
 
213 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0444  L-fuculose phosphate aldolase  39.72 
 
 
213 aa  110  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2268  class II aldolase/adducin family protein  42.36 
 
 
229 aa  102  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.043365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  37.84 
 
 
216 aa  97.4  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4066  class II aldolase/adducin family protein  41.13 
 
 
216 aa  96.7  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  37.5 
 
 
222 aa  94.4  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  35.46 
 
 
218 aa  93.2  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  35.21 
 
 
214 aa  90.9  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  36.81 
 
 
217 aa  90.9  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  38.24 
 
 
215 aa  86.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  37.96 
 
 
216 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3562  L-fuculose-phosphate aldolase  41.23 
 
 
214 aa  86.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.272655  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  33.33 
 
 
214 aa  86.3  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  36.15 
 
 
222 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  35.42 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  33.1 
 
 
219 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  34.31 
 
 
212 aa  77  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10741  L-fuculose-phosphate aldolase  33.86 
 
 
218 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.4342 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5404  class II aldolase/adducin family protein  37.93 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  31.25 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  38.79 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0814  class II aldolase/adducin family protein  40.54 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.537097  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.25 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  30.71 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  31.65 
 
 
214 aa  70.9  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  30.34 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  40 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  35.17 
 
 
227 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  34.72 
 
 
214 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0451  class II aldolase/adducin domain protein  36.36 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0424  class II aldolase/adducin family protein  33 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.130241  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  32.64 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  34.15 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
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NC_007951  Bxe_A4303  class II aldolase/adducin domain protein  32.31 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891034  normal 
 
 
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NC_009972  Haur_3663  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.25 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009504  BOV_A0129  putative aldolase  32.64 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_2271  class II aldolase/adducin-like  34.48 
 
 
197 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.453989  hitchhiker  0.000307852 
 
 
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