More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4810 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4810  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 		 230 aa  473  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.86803  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2684  class II aldolase/adducin family protein  88.24 
 
 		 224 aa  394  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  0.449845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3232  L-fuculose-1-phosphate aldolase  63.56 
 
 		 249 aa  305  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2157  class II aldolase/adducin family protein  65.09 
 
 		 222 aa  297  9e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2573  L-fuculose-phosphate aldolase  62.39 
 
 		 222 aa  294  9e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2364  L-fuculose phosphate aldolase (class II)  55.56 
 
 		 218 aa  241  6e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1025  L-fuculose-phosphate aldolase  55.56 
 
 		 218 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0476  L-fuculose-phosphate aldolase  55.3 
 
 		 214 aa  238  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2128  L-fuculose-phosphate aldolase  55.3 
 
 		 214 aa  238  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2398  L-fuculose-phosphate aldolase  56.22 
 
 		 214 aa  237  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.064801  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5136  L-fuculose-phosphate aldolase  54.63 
 
 		 228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2019  L-fuculose-phosphate aldolase  53.85 
 
 		 236 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1036  class II aldolase/adducin family protein  57.95 
 
 		 201 aa  228  5e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5239  L-fuculose-phosphate aldolase  55.5 
 
 		 216 aa  228  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4772  L-fuculose-phosphate aldolase  55.5 
 
 		 216 aa  228  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5314  L-fuculose-phosphate aldolase  53.74 
 
 		 215 aa  225  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521984  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 225 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  52.61 
 
 		 220 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1122  class II aldolase/adducin family protein  53.21 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.404632 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4174  L-fuculose-phosphate aldolase  50.24 
 
 		 218 aa  219  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2791  L-fuculose-phosphate aldolase  52.91 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0523  L-fuculose-phosphate aldolase  47.39 
 
 		 231 aa  205  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3633  L-fuculose-phosphate aldolase  46.98 
 
 		 238 aa  202  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0359  class II aldolase/adducin-like  49.07 
 
 		 221 aa  201  8e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0888  L-fuculose phosphate aldolase  48.82 
 
 		 215 aa  201  9e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  48.36 
 
 		 215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2778  L-fuculose-phosphate aldolase  52.53 
 
 		 208 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  48.34 
 
 		 215 aa  198  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  48.34 
 
 		 215 aa  198  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  48.34 
 
 		 215 aa  198  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2940  L-fuculose phosphate aldolase  47.89 
 
 		 215 aa  197  9e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0887911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3750  L-fuculose-phosphate aldolase  46.26 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1228  putative L-fuculose phosphate aldolase  46.05 
 
 		 224 aa  191  8e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642951  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  46.45 
 
 		 215 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  46.45 
 
 		 215 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  46.45 
 
 		 215 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3134  L-fuculose phosphate aldolase  46.45 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248467 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  45.97 
 
 		 215 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3336  class II aldolase/adducin, N-terminal  46.63 
 
 		 209 aa  185  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348459 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2482  class II aldolase/adducin family protein  39.73 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000186834  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2248  class II aldolase/adducin family protein  44.6 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.589142  normal  0.160982 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2494  L-fuculose-phosphate aldolase  42.65 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3293  class II aldolase/adducin family protein  45.19 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178192  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  41.04 
 
 		 215 aa  163  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3550  class II aldolase/adducin family protein  41.71 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  37.68 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  37.8 
 
 		 213 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  36.84 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  39.81 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  39.52 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  38.86 
 
 		 220 aa  141  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  41.9 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  39.72 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3072  L-fuculose phosphate aldolase  48.28 
 
 		 152 aa  139  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0460293  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4066  class II aldolase/adducin family protein  37.2 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  37.14 
 
 		 212 aa  135  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  36.32 
 
 		 217 aa  131  9e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  35.14 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0040  class II aldolase/adducin family protein  39.71 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0444  L-fuculose phosphate aldolase  37.8 
 
 		 213 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0328  L-fuculose phosphate aldolase  36.84 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4923  L-fuculose phosphate aldolase  37.32 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0442  L-fuculose phosphate aldolase  37.8 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0395  L-fuculose phosphate aldolase  37.32 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0333  L-fuculose phosphate aldolase  37.32 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.618561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0317  L-fuculose phosphate aldolase  37.32 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0320  L-fuculose phosphate aldolase  37.32 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.4164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0380  L-fuculose phosphate aldolase  37.32 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  33.5 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0348  L-fuculose phosphate aldolase  36.84 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  38.31 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10741  L-fuculose-phosphate aldolase  37.43 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.4342 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  35.85 
 
 		 219 aa  118  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  34.85 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  37.07 
 
 		 207 aa  115  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  34.58 
 
 		 212 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3562  L-fuculose-phosphate aldolase  38.71 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.272655  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2784  class II aldolase/adducin family protein  33.96 
 
 		 213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  35.15 
 
 		 214 aa  112  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1656  aminotransferase  34.8 
 
 		 753 aa  109  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12102  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0629  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  32.5 
 
 		 212 aa  110  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2268  class II aldolase/adducin family protein  35.15 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.043365 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  34.62 
 
 		 218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0654  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  32 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1149  class II aldolase/adducin family protein  34.64 
 
 		 215 aa  108  8.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  36.96 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.5 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  32.72 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  36.67 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3663  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  35.26 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  33.84 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6218  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  33.64 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.948817 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  34.57 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.1 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  30.94 
 
 		 264 aa  98.2  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  31.19 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  35.8 
 
 		 189 aa  95.9  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  36.24 
 
 		 210 aa  95.5  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0780  L-fuculose phosphate aldolase  35.81 
 
 		 220 aa  94.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.509551  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06100  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  34.74 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.214658  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>