More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3562 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3562  L-fuculose-phosphate aldolase  100 
 
 		 214 aa  426  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.272655  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  42.99 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_4066  class II aldolase/adducin family protein  47.28 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  44.23 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
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NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  40.54 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2791  L-fuculose-phosphate aldolase  46.55 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_1036  class II aldolase/adducin family protein  41.11 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1025  L-fuculose-phosphate aldolase  38.19 
 
 		 218 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4923  L-fuculose phosphate aldolase  38.17 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191657  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0395  L-fuculose phosphate aldolase  38.17 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2364  L-fuculose phosphate aldolase (class II)  37.69 
 
 		 218 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0328  L-fuculose phosphate aldolase  38.71 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5314  L-fuculose-phosphate aldolase  38.94 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521984  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  36.26 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_0476  L-fuculose-phosphate aldolase  38.19 
 
 		 214 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_5136  L-fuculose-phosphate aldolase  37.81 
 
 		 228 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2128  L-fuculose-phosphate aldolase  38.19 
 
 		 214 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007530  GBAA_0348  L-fuculose phosphate aldolase  38.3 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  41.24 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0333  L-fuculose phosphate aldolase  37.63 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.618561  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0317  L-fuculose phosphate aldolase  37.63 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0320  L-fuculose phosphate aldolase  37.63 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.4164  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0380  L-fuculose phosphate aldolase  37.63 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_0444  L-fuculose phosphate aldolase  37.63 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0442  L-fuculose phosphate aldolase  37.63 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_2398  L-fuculose-phosphate aldolase  38.69 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.064801  normal  0.908547 
 
 
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NC_010511  M446_2684  class II aldolase/adducin family protein  41.03 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  0.449845 
 
 
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NC_010172  Mext_4772  L-fuculose-phosphate aldolase  39.39 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_5239  L-fuculose-phosphate aldolase  39.39 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554285 
 
 
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NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  40.11 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  34.41 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A3134  L-fuculose phosphate aldolase  38.38 
 
 		 215 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248467 
 
 
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NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  40.24 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  40.24 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  40.24 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  40.24 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal  1 
 
 
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NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  36.79 
 
 		 220 aa  118  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.190003 
 
 
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NC_011894  Mnod_4810  class II aldolase/adducin family protein  37 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.86803  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_0888  L-fuculose phosphate aldolase  39.63 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  39.63 
 
 		 215 aa  115  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  39.63 
 
 		 215 aa  115  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  39.63 
 
 		 215 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  39.63 
 
 		 215 aa  115  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014211  Ndas_5404  class II aldolase/adducin family protein  38.42 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2940  L-fuculose phosphate aldolase  39.63 
 
 		 215 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0887911  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  34.42 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_2778  L-fuculose-phosphate aldolase  38.12 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_4174  L-fuculose-phosphate aldolase  35.03 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  35.98 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014150  Bmur_2494  L-fuculose-phosphate aldolase  31.73 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  35.64 
 
 		 214 aa  112  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_1122  class II aldolase/adducin family protein  35.86 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.404632 
 
 
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NC_007908  Rfer_3750  L-fuculose-phosphate aldolase  37.5 
 
 		 227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_3550  class II aldolase/adducin family protein  35.64 
 
 		 214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009620  Smed_3633  L-fuculose-phosphate aldolase  34.47 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008786  Veis_2019  L-fuculose-phosphate aldolase  37.62 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
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NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  32.78 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3293  class II aldolase/adducin family protein  41.57 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178192  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_2573  L-fuculose-phosphate aldolase  33.9 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012029  Hlac_2268  class II aldolase/adducin family protein  37.69 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.043365 
 
 
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NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  36.9 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2784  class II aldolase/adducin family protein  37.77 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
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NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  38.8 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_0523  L-fuculose-phosphate aldolase  34.67 
 
 		 231 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014150  Bmur_2482  class II aldolase/adducin family protein  35.4 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000186834  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  33.93 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  37.36 
 
 		 219 aa  101  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
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NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  36.11 
 
 		 265 aa  101  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
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NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  34.62 
 
 		 219 aa  101  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3336  class II aldolase/adducin, N-terminal  35.76 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348459 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  35.48 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
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NC_009636  Smed_2157  class II aldolase/adducin family protein  35.29 
 
 		 222 aa  99.4  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  31.4 
 
 		 180 aa  99  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A0359  class II aldolase/adducin-like  34.64 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  31.98 
 
 		 190 aa  99  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  36.02 
 
 		 212 aa  98.2  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  33.9 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  34.17 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  27.93 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  30.29 
 
 		 181 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  33.51 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0424  class II aldolase/adducin family protein  31.21 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.130241  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  33.33 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3232  L-fuculose-1-phosphate aldolase  33.14 
 
 		 249 aa  95.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1697  class II aldolase/adducin family protein  32.97 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  36.26 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2248  class II aldolase/adducin family protein  36.67 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.589142  normal  0.160982 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  34.94 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  27.93 
 
 		 180 aa  92  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10741  L-fuculose-phosphate aldolase  36.76 
 
 		 218 aa  92  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.4342 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0939  class II aldolase/adducin family protein  37.89 
 
 		 185 aa  91.3  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.100017 
 
 
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NC_013517  Sterm_0040  class II aldolase/adducin family protein  34.5 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104047  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0814  class II aldolase/adducin family protein  35.56 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.537097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  30.53 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  36.81 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  33.94 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  30.23 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  36.25 
 
 		 189 aa  87.8  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal  1 
 
 
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NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  35.16 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal  1 
 
 
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