More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0523 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0523  L-fuculose-phosphate aldolase  100 
 
 		 231 aa  478  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3232  L-fuculose-1-phosphate aldolase  50 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2573  L-fuculose-phosphate aldolase  48.54 
 
 		 222 aa  208  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4810  class II aldolase/adducin family protein  47.39 
 
 		 230 aa  205  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.86803  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  48.6 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2157  class II aldolase/adducin family protein  47.22 
 
 		 222 aa  201  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2684  class II aldolase/adducin family protein  47.42 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  0.449845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5136  L-fuculose-phosphate aldolase  44.39 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4174  L-fuculose-phosphate aldolase  45.1 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2398  L-fuculose-phosphate aldolase  46.89 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.064801  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5239  L-fuculose-phosphate aldolase  47.47 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4772  L-fuculose-phosphate aldolase  47.47 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0476  L-fuculose-phosphate aldolase  45.93 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2128  L-fuculose-phosphate aldolase  45.93 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1025  L-fuculose-phosphate aldolase  42.2 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2364  L-fuculose phosphate aldolase (class II)  42.2 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0888  L-fuculose phosphate aldolase  44.5 
 
 		 215 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  44.5 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  44.5 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  44.5 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  44.5 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3134  L-fuculose phosphate aldolase  44.5 
 
 		 215 aa  175  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248467 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  44.02 
 
 		 215 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  44.02 
 
 		 215 aa  176  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  44.02 
 
 		 215 aa  176  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2791  L-fuculose-phosphate aldolase  44.55 
 
 		 223 aa  175  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1122  class II aldolase/adducin family protein  44.19 
 
 		 221 aa  174  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.404632 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2940  L-fuculose phosphate aldolase  44.02 
 
 		 215 aa  174  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0887911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  43.54 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5314  L-fuculose-phosphate aldolase  45.45 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521984  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1228  putative L-fuculose phosphate aldolase  41.26 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642951  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2019  L-fuculose-phosphate aldolase  43.64 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1036  class II aldolase/adducin family protein  46.7 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2494  L-fuculose-phosphate aldolase  39.27 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3633  L-fuculose-phosphate aldolase  41.23 
 
 		 238 aa  168  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2482  class II aldolase/adducin family protein  39.11 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000186834  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2248  class II aldolase/adducin family protein  44.55 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.589142  normal  0.160982 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2778  L-fuculose-phosphate aldolase  41.46 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3336  class II aldolase/adducin, N-terminal  43.75 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348459 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  37.74 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3293  class II aldolase/adducin family protein  42.79 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178192  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  38.83 
 
 		 219 aa  148  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0359  class II aldolase/adducin-like  40.76 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  37.62 
 
 		 215 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  38.02 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2268  class II aldolase/adducin family protein  39.58 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.043365 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3750  L-fuculose-phosphate aldolase  37.25 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  34.95 
 
 		 220 aa  132  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  35.58 
 
 		 237 aa  128  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4066  class II aldolase/adducin family protein  34.13 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  34.47 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3072  L-fuculose phosphate aldolase  43.15 
 
 		 152 aa  122  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0460293  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  34.13 
 
 		 213 aa  121  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  33.65 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3550  class II aldolase/adducin family protein  34.13 
 
 		 214 aa  119  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  37.37 
 
 		 215 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  33.01 
 
 		 214 aa  118  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  33.33 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2784  class II aldolase/adducin family protein  36.41 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0040  class II aldolase/adducin family protein  35.09 
 
 		 212 aa  114  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104047  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  34.54 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  33.18 
 
 		 219 aa  111  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  32.31 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  32.37 
 
 		 217 aa  109  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  32.06 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  31.35 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0328  L-fuculose phosphate aldolase  32.21 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  31.13 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  29.7 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4923  L-fuculose phosphate aldolase  31.73 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  32.76 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0395  L-fuculose phosphate aldolase  31.73 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  30.73 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0444  L-fuculose phosphate aldolase  31.73 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0333  L-fuculose phosphate aldolase  31.73 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.618561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0317  L-fuculose phosphate aldolase  31.73 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0320  L-fuculose phosphate aldolase  31.73 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.4164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0380  L-fuculose phosphate aldolase  31.73 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0442  L-fuculose phosphate aldolase  31.73 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  32.98 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  33.85 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0654  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.81 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0629  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.47 
 
 		 212 aa  102  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0348  L-fuculose phosphate aldolase  31.25 
 
 		 213 aa  99.4  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3562  L-fuculose-phosphate aldolase  34.78 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.272655  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  31.98 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  34.91 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  31.94 
 
 		 212 aa  95.5  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10741  L-fuculose-phosphate aldolase  36.81 
 
 		 218 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.4342 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1656  aminotransferase  31.02 
 
 		 753 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12102  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  32.81 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  30.86 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  32.04 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  29.44 
 
 		 220 aa  92.4  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  28.95 
 
 		 303 aa  90.1  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  28.17 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  25.71 
 
 		 398 aa  88.2  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  31.48 
 
 		 189 aa  88.2  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0780  L-fuculose phosphate aldolase  31.1 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.509551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>