More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2398 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2398  L-fuculose-phosphate aldolase  100 
 
 		 214 aa  434  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.064801  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0476  L-fuculose-phosphate aldolase  92.99 
 
 		 214 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2128  L-fuculose-phosphate aldolase  92.99 
 
 		 214 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1025  L-fuculose-phosphate aldolase  72.82 
 
 		 218 aa  320  7e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2364  L-fuculose phosphate aldolase (class II)  72.82 
 
 		 218 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4174  L-fuculose-phosphate aldolase  57.64 
 
 		 218 aa  259  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  58.69 
 
 		 225 aa  253  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2791  L-fuculose-phosphate aldolase  57.75 
 
 		 223 aa  249  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1122  class II aldolase/adducin family protein  59.33 
 
 		 221 aa  245  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.404632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5314  L-fuculose-phosphate aldolase  59.11 
 
 		 215 aa  244  8e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521984  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5239  L-fuculose-phosphate aldolase  60.1 
 
 		 216 aa  244  9e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4772  L-fuculose-phosphate aldolase  60.1 
 
 		 216 aa  244  9e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5136  L-fuculose-phosphate aldolase  55.56 
 
 		 228 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  55.29 
 
 		 220 aa  239  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2684  class II aldolase/adducin family protein  57.6 
 
 		 224 aa  238  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  0.449845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4810  class II aldolase/adducin family protein  56.22 
 
 		 230 aa  237  8e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.86803  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1036  class II aldolase/adducin family protein  58.88 
 
 		 201 aa  234  6e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2573  L-fuculose-phosphate aldolase  53.85 
 
 		 222 aa  234  6e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0888  L-fuculose phosphate aldolase  54.25 
 
 		 215 aa  224  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  54.25 
 
 		 215 aa  224  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  54.25 
 
 		 215 aa  224  8e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  54.25 
 
 		 215 aa  224  8e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  54.25 
 
 		 215 aa  224  8e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2940  L-fuculose phosphate aldolase  54.25 
 
 		 215 aa  223  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0887911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0359  class II aldolase/adducin-like  54.68 
 
 		 221 aa  222  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  55.88 
 
 		 215 aa  221  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  55.39 
 
 		 215 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  55.39 
 
 		 215 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  55.39 
 
 		 215 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3633  L-fuculose-phosphate aldolase  50 
 
 		 238 aa  218  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3232  L-fuculose-1-phosphate aldolase  50.93 
 
 		 249 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2019  L-fuculose-phosphate aldolase  52.8 
 
 		 236 aa  218  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2157  class II aldolase/adducin family protein  53.05 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3134  L-fuculose phosphate aldolase  54.41 
 
 		 215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248467 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2778  L-fuculose-phosphate aldolase  53.77 
 
 		 208 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3750  L-fuculose-phosphate aldolase  50.48 
 
 		 227 aa  210  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2494  L-fuculose-phosphate aldolase  45.07 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1228  putative L-fuculose phosphate aldolase  49.29 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642951  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2482  class II aldolase/adducin family protein  41.87 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000186834  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3336  class II aldolase/adducin, N-terminal  47.8 
 
 		 209 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348459 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0523  L-fuculose-phosphate aldolase  46.89 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2248  class II aldolase/adducin family protein  49.76 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.589142  normal  0.160982 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  43.4 
 
 		 215 aa  184  7e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3293  class II aldolase/adducin family protein  46.57 
 
 		 229 aa  171  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3072  L-fuculose phosphate aldolase  55.56 
 
 		 152 aa  160  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0460293  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  40.49 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  39.23 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  44.02 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  40.1 
 
 		 220 aa  148  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4923  L-fuculose phosphate aldolase  39.81 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0395  L-fuculose phosphate aldolase  39.34 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0444  L-fuculose phosphate aldolase  39.81 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0333  L-fuculose phosphate aldolase  39.34 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.618561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0317  L-fuculose phosphate aldolase  39.34 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0320  L-fuculose phosphate aldolase  39.34 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.4164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0380  L-fuculose phosphate aldolase  39.34 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0442  L-fuculose phosphate aldolase  39.34 
 
 		 213 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3550  class II aldolase/adducin family protein  40.57 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0328  L-fuculose phosphate aldolase  38.86 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  39.71 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0348  L-fuculose phosphate aldolase  38.86 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  38.86 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  39.52 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2268  class II aldolase/adducin family protein  41.84 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.043365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4066  class II aldolase/adducin family protein  37.98 
 
 		 216 aa  135  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  41.75 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  37.38 
 
 		 212 aa  125  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2784  class II aldolase/adducin family protein  38.86 
 
 		 213 aa  125  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  34.52 
 
 		 211 aa  125  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  36.55 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0040  class II aldolase/adducin family protein  36.76 
 
 		 212 aa  121  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104047  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  37.5 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  38.17 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3562  L-fuculose-phosphate aldolase  39.67 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.272655  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  30.15 
 
 		 212 aa  115  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  32.63 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  35.38 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5404  class II aldolase/adducin family protein  33.82 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  39.75 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  36.55 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.81 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10741  L-fuculose-phosphate aldolase  35.14 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.4342 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  35.26 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  34.55 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3663  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  33.5 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1302  class II aldolase/adducin family protein  34.52 
 
 		 427 aa  95.5  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  29.7 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  28.43 
 
 		 303 aa  91.3  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0780  L-fuculose phosphate aldolase  36.11 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.509551  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  36.25 
 
 		 189 aa  90.1  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  29.61 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0750  class II aldolase/adducin family protein  31.86 
 
 		 230 aa  88.2  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06100  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  31.37 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.214658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4089  class II aldolase/adducin family protein  39.52 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117914 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0654  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.86 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  33.18 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.93 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0243  class II aldolase/adducin family protein  32.85 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365034  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  30.27 
 
 		 428 aa  85.5  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>