208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0910 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  100 
 
 
124 aa  251  3e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  55.75 
 
 
133 aa  113  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  41.41 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  42.62 
 
 
139 aa  95.5  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  42.19 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  44.12 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  42.5 
 
 
142 aa  92  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  44.23 
 
 
145 aa  90.1  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  41.41 
 
 
167 aa  89.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  44.68 
 
 
150 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  41.96 
 
 
139 aa  87  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  42.86 
 
 
151 aa  84.7  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  46.15 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  46.15 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  39.8 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  44.57 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  41.58 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  37.96 
 
 
180 aa  82  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  45.74 
 
 
160 aa  82  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  38.53 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  38.05 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  44.12 
 
 
294 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  39.25 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  37.27 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  36.29 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  34.09 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  35.61 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  36.36 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  34.38 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  36.04 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  34.17 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  33.86 
 
 
153 aa  77  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  38.28 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  33.64 
 
 
153 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  35.71 
 
 
160 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  38.68 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  35.78 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  33.64 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  35.61 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  45.1 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  37.11 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  42.11 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  35 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  33.61 
 
 
160 aa  73.6  0.0000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  32.03 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  43.16 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  35.25 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  39.56 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  39.05 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  33.93 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  36.7 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  42 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  36.54 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  31.2 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  37.37 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  31.25 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  37.17 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  32.12 
 
 
135 aa  72  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  37.17 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0302  hypothetical protein  38.53 
 
 
155 aa  72  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  34.88 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3420  hypothetical protein  36.7 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82049  normal  0.0336552 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  36.63 
 
 
171 aa  72  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  36.19 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  39.81 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  35.35 
 
 
183 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  34.59 
 
 
235 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  31.25 
 
 
230 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  30.71 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  31.19 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0617685 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  38.83 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  38.46 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  29.91 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  38.83 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  38.83 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  38.83 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  38.83 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  38.83 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  38.83 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  42.39 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  42.39 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0874  protein of unknown function UPF0066  39.81 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  38.83 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  32.03 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  34.02 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.22 
 
 
311 aa  68.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  34.62 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  37.36 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  32.56 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  38.83 
 
 
235 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  35.29 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  37.89 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  37.36 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  30.47 
 
 
240 aa  67.8  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  31.25 
 
 
230 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  36.26 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>