205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4335 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4335  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  316  9e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3420  hypothetical protein  52.9 
 
 		 159 aa  173  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82049  normal  0.0336552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  56.46 
 
 		 151 aa  168  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2421  hypothetical protein  49.67 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11336  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  40.67 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  40.67 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  39.33 
 
 		 159 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2252  hypothetical protein  39.33 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.89628e-27 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0302  hypothetical protein  42.18 
 
 		 155 aa  134  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  38.67 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  133  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  39.33 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  41.33 
 
 		 154 aa  130  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  41.33 
 
 		 153 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3133  putative transcriptional regulator  44.59 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1303  protein of unknown function UPF0066  43.95 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  33.11 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  33.11 
 
 		 152 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  37.61 
 
 		 182 aa  84  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  42.86 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  35.07 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  35.4 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03251  hypothetical protein  38.89 
 
 		 231 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0401  hypothetical protein  41.12 
 
 		 231 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000112089  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  30.2 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  40 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  38.46 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0535  hypothetical protein  36.49 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  31.72 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002726  hypothetical protein  39.81 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0430932  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  42.73 
 
 		 235 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  39.47 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  37.7 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  41.44 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  38.58 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  42.48 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  40.54 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  42.55 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  39.64 
 
 		 238 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  36.89 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  38.6 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0891  hypothetical protein  39.05 
 
 		 232 aa  71.2  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  42.34 
 
 		 235 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  42.34 
 
 		 235 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  35.56 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  42.34 
 
 		 235 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  42.34 
 
 		 235 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  42.34 
 
 		 235 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  42.34 
 
 		 235 aa  70.9  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  36.24 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  40.38 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  42.34 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  42.34 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  42.34 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  33.04 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  30 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  42.11 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  36.22 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  44.94 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  41.44 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  41.38 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  43.62 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  34.91 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  41.38 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  41.38 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  41.38 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  41.38 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  37.6 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  37.27 
 
 		 265 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  35.07 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  41.59 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  37.01 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  40.38 
 
 		 240 aa  68.2  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  38.58 
 
 		 237 aa  67.8  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  31.95 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  40.38 
 
 		 230 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  39.42 
 
 		 239 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  40.38 
 
 		 231 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  39.42 
 
 		 234 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  43.33 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3151  hypothetical protein  36.11 
 
 		 244 aa  67  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  39.42 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  35.45 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  40.38 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  42.31 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  39.09 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  39.09 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  35.43 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  40.43 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  39.09 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  33.09 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  36.45 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  36.11 
 
 		 248 aa  64.3  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  34.65 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  40.66 
 
 		 231 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>