50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03788 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03788  rhamnulose-1-phosphate aldolase  100 
 
 		 274 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03737  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4293  rhamnulose-1-phosphate aldolase  98.54 
 
 		 274 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4433  rhamnulose-1-phosphate aldolase  98.91 
 
 		 274 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4082  rhamnulose-1-phosphate aldolase  98.18 
 
 		 274 aa  559  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4115  rhamnulose-1-phosphate aldolase  98.18 
 
 		 274 aa  559  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4130  rhamnulose-1-phosphate aldolase  98.18 
 
 		 274 aa  559  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5354  rhamnulose-1-phosphate aldolase  97.45 
 
 		 274 aa  553  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4440  rhamnulose-1-phosphate aldolase  91.24 
 
 		 275 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4288  rhamnulose-1-phosphate aldolase  91.24 
 
 		 275 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4259  rhamnulose-1-phosphate aldolase  90.88 
 
 		 275 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.199258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4374  rhamnulose-1-phosphate aldolase  91.24 
 
 		 275 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4328  rhamnulose-1-phosphate aldolase  91.24 
 
 		 275 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.187622 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4069  rhamnulose-1-phosphate aldolase  89.78 
 
 		 276 aa  519  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.703953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0497  rhamnulose-1-phosphate aldolase  75 
 
 		 274 aa  430  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0418  rhamnulose-1-phosphate aldolase  75 
 
 		 274 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3611  rhamnulose-1-phosphate aldolase  73.53 
 
 		 276 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3487  rhamnulose-1-phosphate aldolase  72.43 
 
 		 274 aa  418  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0745  rhamnulose-1-phosphate aldolase  67.65 
 
 		 274 aa  397  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.103883 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3847  rhamnulose-1-phosphate aldolase  67.65 
 
 		 274 aa  397  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3757  rhamnulose-1-phosphate aldolase  67.28 
 
 		 274 aa  394  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  97.48 
 
 		 471 aa  323  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3785  Rhamnulose-1-phosphate aldolase  52.38 
 
 		 274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1116  Rhamnulose-1-phosphate aldolase  39.75 
 
 		 301 aa  198  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000171192  hitchhiker  0.000000000000494113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1581  rhamnulose-1-phosphate aldolase  31.46 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2638  rhamnulose-1-phosphate aldolase  28.97 
 
 		 287 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1745  rhamnulose-1-phosphate aldolase  26.84 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0338141  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1672  rhamnulose-1-phosphate aldolase  27.27 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.191632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  23.9 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  26.23 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  25.32 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4213  class II aldolase/adducin family protein  27.54 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511631  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  25 
 
 		 211 aa  47  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  24.18 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  25.58 
 
 		 217 aa  46.6  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  26.63 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  23.53 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  25 
 
 		 222 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  25.14 
 
 		 221 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  25.97 
 
 		 224 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  23.42 
 
 		 214 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1302  class II aldolase/adducin family protein  27.74 
 
 		 427 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  23.03 
 
 		 220 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  22.67 
 
 		 225 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  30.77 
 
 		 225 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4065  class II aldolase/adducin-like  26.34 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1661  L-fuculose phosphate aldolase  29.41 
 
 		 180 aa  42.7  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3215  class II aldolase/adducin family protein  27.59 
 
 		 216 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.549465  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0362  class II aldolase/adducin family protein  31.17 
 
 		 241 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0763324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1801  L-fuculose phosphate aldolase  41.18 
 
 		 178 aa  42.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.30516  normal  0.168684 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>