72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3785 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3785  Rhamnulose-1-phosphate aldolase  100 
 
 
274 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0497  rhamnulose-1-phosphate aldolase  54.58 
 
 
274 aa  322  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0418  rhamnulose-1-phosphate aldolase  54.21 
 
 
274 aa  319  3e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3487  rhamnulose-1-phosphate aldolase  54.41 
 
 
274 aa  319  3e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3611  rhamnulose-1-phosphate aldolase  53.14 
 
 
276 aa  318  7e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3847  rhamnulose-1-phosphate aldolase  53.14 
 
 
274 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0745  rhamnulose-1-phosphate aldolase  53.14 
 
 
274 aa  311  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.103883 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4082  rhamnulose-1-phosphate aldolase  53.11 
 
 
274 aa  310  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4115  rhamnulose-1-phosphate aldolase  53.11 
 
 
274 aa  310  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4130  rhamnulose-1-phosphate aldolase  53.11 
 
 
274 aa  310  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3757  rhamnulose-1-phosphate aldolase  53.14 
 
 
274 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4069  rhamnulose-1-phosphate aldolase  53.85 
 
 
276 aa  309  2.9999999999999997e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.703953  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4433  rhamnulose-1-phosphate aldolase  52.75 
 
 
274 aa  308  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4293  rhamnulose-1-phosphate aldolase  52.75 
 
 
274 aa  309  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5354  rhamnulose-1-phosphate aldolase  53.11 
 
 
274 aa  308  5e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4288  rhamnulose-1-phosphate aldolase  52.75 
 
 
275 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4259  rhamnulose-1-phosphate aldolase  52.75 
 
 
275 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.199258  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4374  rhamnulose-1-phosphate aldolase  52.75 
 
 
275 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4328  rhamnulose-1-phosphate aldolase  52.75 
 
 
275 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.187622 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4440  rhamnulose-1-phosphate aldolase  52.75 
 
 
275 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03788  rhamnulose-1-phosphate aldolase  52.38 
 
 
274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03737  hypothetical protein  52.38 
 
 
274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1116  Rhamnulose-1-phosphate aldolase  39.02 
 
 
301 aa  222  4e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000171192  hitchhiker  0.000000000000494113 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  57.23 
 
 
471 aa  202  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1745  rhamnulose-1-phosphate aldolase  32.63 
 
 
236 aa  122  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0338141  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1672  rhamnulose-1-phosphate aldolase  34.45 
 
 
236 aa  122  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.191632  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1581  rhamnulose-1-phosphate aldolase  28.3 
 
 
274 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2638  rhamnulose-1-phosphate aldolase  25.2 
 
 
287 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  26.52 
 
 
212 aa  57.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  25.25 
 
 
219 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  25.56 
 
 
214 aa  55.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  22.5 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  22.39 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  22.61 
 
 
215 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  24.18 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  23.88 
 
 
227 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1697  class II aldolase/adducin family protein  27.69 
 
 
188 aa  49.7  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  23.33 
 
 
217 aa  49.3  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  22.57 
 
 
210 aa  48.9  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  29.67 
 
 
225 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  22.29 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  27.33 
 
 
210 aa  48.5  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  21.02 
 
 
221 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1661  L-fuculose phosphate aldolase  32.35 
 
 
180 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4213  class II aldolase/adducin family protein  24.12 
 
 
235 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511631  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4065  class II aldolase/adducin-like  24.12 
 
 
235 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  21.02 
 
 
222 aa  46.6  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  22.45 
 
 
222 aa  45.8  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  34.78 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  21.79 
 
 
224 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4188  class II aldolase/adducin family protein  24.12 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0814  class II aldolase/adducin family protein  23.12 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.537097  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3173  L-fuculose phosphate aldolase  28.44 
 
 
178 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  20.38 
 
 
218 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  21.79 
 
 
222 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1801  L-fuculose phosphate aldolase  28.15 
 
 
178 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.30516  normal  0.168684 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  21.76 
 
 
215 aa  44.3  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  24.52 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  19.87 
 
 
220 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  24.67 
 
 
181 aa  43.9  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  24.52 
 
 
231 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  25.48 
 
 
215 aa  43.9  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  18.47 
 
 
226 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0068  class II aldolase/adducin family protein  31.46 
 
 
213 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  21.26 
 
 
210 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1302  class II aldolase/adducin family protein  21.8 
 
 
427 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  21.43 
 
 
225 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  20.13 
 
 
265 aa  42.7  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  21.15 
 
 
220 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2494  L-fuculose-phosphate aldolase  22.62 
 
 
222 aa  42.4  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06100  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  25.19 
 
 
228 aa  42.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.214658  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  25.68 
 
 
214 aa  42.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>