More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1072 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1072  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 		 189 aa  375  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0939  class II aldolase/adducin family protein  71.04 
 
 		 185 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.100017 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0814  class II aldolase/adducin family protein  74.03 
 
 		 192 aa  270  9e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.537097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  71.67 
 
 		 189 aa  262  2e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1697  class II aldolase/adducin family protein  40.74 
 
 		 188 aa  134  9e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  42.86 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  38.51 
 
 		 181 aa  121  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  36.81 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  35.05 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  30.98 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  35.47 
 
 		 190 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  35.56 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  35.67 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2364  L-fuculose phosphate aldolase (class II)  38.89 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  36.22 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1025  L-fuculose-phosphate aldolase  38.89 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0929  class II aldolase/adducin family protein  36.84 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  35.68 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  33.53 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  35.84 
 
 		 265 aa  106  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  32.58 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  37.3 
 
 		 222 aa  104  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  34.44 
 
 		 212 aa  102  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  36.36 
 
 		 234 aa  101  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  35.93 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3232  L-fuculose-1-phosphate aldolase  37.72 
 
 		 249 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2778  L-fuculose-phosphate aldolase  37.65 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  38.04 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  34.44 
 
 		 303 aa  99.4  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  37.42 
 
 		 222 aa  99.4  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  34.97 
 
 		 215 aa  99  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  37.85 
 
 		 215 aa  98.2  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3384  class II aldolase/adducin family protein  37.84 
 
 		 213 aa  98.2  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0040  class II aldolase/adducin family protein  35.1 
 
 		 212 aa  97.8  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4174  L-fuculose-phosphate aldolase  36.36 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  35.47 
 
 		 216 aa  97.1  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0888  L-fuculose phosphate aldolase  40.24 
 
 		 215 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  38.8 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  40.24 
 
 		 215 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  40.24 
 
 		 215 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  40.24 
 
 		 215 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  33.93 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  36.46 
 
 		 211 aa  95.1  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  32.61 
 
 		 212 aa  94.7  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2940  L-fuculose phosphate aldolase  40.24 
 
 		 215 aa  94.7  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0887911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  34.09 
 
 		 219 aa  94.7  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  32.42 
 
 		 220 aa  94  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2157  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 		 222 aa  94  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0328  L-fuculose phosphate aldolase  32.76 
 
 		 213 aa  93.2  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  39.13 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  39.13 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  39.13 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  34.59 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  39.13 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3134  L-fuculose phosphate aldolase  39.13 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248467 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3750  L-fuculose-phosphate aldolase  35.37 
 
 		 227 aa  92.4  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0395  L-fuculose phosphate aldolase  32.18 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0333  L-fuculose phosphate aldolase  35.06 
 
 		 213 aa  91.7  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.618561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0317  L-fuculose phosphate aldolase  35.06 
 
 		 213 aa  91.7  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0320  L-fuculose phosphate aldolase  35.06 
 
 		 213 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.4164  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0348  L-fuculose phosphate aldolase  35.06 
 
 		 213 aa  91.7  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0380  L-fuculose phosphate aldolase  35.06 
 
 		 213 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0444  L-fuculose phosphate aldolase  34.42 
 
 		 213 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4066  class II aldolase/adducin family protein  37.5 
 
 		 216 aa  91.3  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4923  L-fuculose phosphate aldolase  32.18 
 
 		 213 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0424  class II aldolase/adducin family protein  33.13 
 
 		 222 aa  91.7  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.130241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2684  class II aldolase/adducin family protein  32.77 
 
 		 224 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  0.449845 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0442  L-fuculose phosphate aldolase  34.42 
 
 		 213 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0359  class II aldolase/adducin-like  37.72 
 
 		 221 aa  91.3  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  33.33 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4213  class II aldolase/adducin family protein  38 
 
 		 235 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511631  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0654  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.64 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0629  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.64 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3562  L-fuculose-phosphate aldolase  36.6 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.272655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4810  class II aldolase/adducin family protein  31.18 
 
 		 230 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.86803  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2573  L-fuculose-phosphate aldolase  32.32 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1656  aminotransferase  35.59 
 
 		 753 aa  89.4  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12102  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  38.75 
 
 		 220 aa  89  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4065  class II aldolase/adducin-like  37.33 
 
 		 235 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  34.44 
 
 		 225 aa  89  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  34.57 
 
 		 237 aa  89  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4188  class II aldolase/adducin family protein  37.33 
 
 		 235 aa  88.2  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1228  putative L-fuculose phosphate aldolase  35.96 
 
 		 224 aa  87.8  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642951  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.72 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  36.97 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  34.62 
 
 		 215 aa  87  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.41 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2791  L-fuculose-phosphate aldolase  36.81 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5136  L-fuculose-phosphate aldolase  32.9 
 
 		 228 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1122  class II aldolase/adducin family protein  37.76 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.404632 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2019  L-fuculose-phosphate aldolase  35.87 
 
 		 236 aa  86.7  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2248  class II aldolase/adducin family protein  37.01 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.589142  normal  0.160982 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  34.3 
 
 		 222 aa  85.9  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2398  L-fuculose-phosphate aldolase  39.29 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.064801  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 225 aa  85.5  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4089  class II aldolase/adducin family protein  40.13 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117914 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  32.57 
 
 		 213 aa  85.5  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  34.73 
 
 		 219 aa  85.1  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0476  L-fuculose-phosphate aldolase  39.01 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2128  L-fuculose-phosphate aldolase  39.01 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>