45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4440 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4440  rhamnulose-1-phosphate aldolase  100 
 
 		 275 aa  571  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4328  rhamnulose-1-phosphate aldolase  99.64 
 
 		 275 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.187622 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4374  rhamnulose-1-phosphate aldolase  99.64 
 
 		 275 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4259  rhamnulose-1-phosphate aldolase  99.27 
 
 		 275 aa  567  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.199258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4288  rhamnulose-1-phosphate aldolase  99.64 
 
 		 275 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4115  rhamnulose-1-phosphate aldolase  91.61 
 
 		 274 aa  534  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4130  rhamnulose-1-phosphate aldolase  91.61 
 
 		 274 aa  534  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4082  rhamnulose-1-phosphate aldolase  91.61 
 
 		 274 aa  534  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4433  rhamnulose-1-phosphate aldolase  91.61 
 
 		 274 aa  532  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4293  rhamnulose-1-phosphate aldolase  91.61 
 
 		 274 aa  532  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5354  rhamnulose-1-phosphate aldolase  91.61 
 
 		 274 aa  528  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4069  rhamnulose-1-phosphate aldolase  90.18 
 
 		 276 aa  527  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.703953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03737  hypothetical protein  91.24 
 
 		 274 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03788  rhamnulose-1-phosphate aldolase  91.24 
 
 		 274 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3611  rhamnulose-1-phosphate aldolase  73.53 
 
 		 276 aa  430  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0497  rhamnulose-1-phosphate aldolase  72.79 
 
 		 274 aa  426  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0418  rhamnulose-1-phosphate aldolase  72.79 
 
 		 274 aa  425  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3487  rhamnulose-1-phosphate aldolase  70.59 
 
 		 274 aa  415  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3847  rhamnulose-1-phosphate aldolase  65.81 
 
 		 274 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0745  rhamnulose-1-phosphate aldolase  65.81 
 
 		 274 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.103883 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3757  rhamnulose-1-phosphate aldolase  65.44 
 
 		 274 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  91.82 
 
 		 471 aa  311  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3785  Rhamnulose-1-phosphate aldolase  52.75 
 
 		 274 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1116  Rhamnulose-1-phosphate aldolase  38.49 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000171192  hitchhiker  0.000000000000494113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1581  rhamnulose-1-phosphate aldolase  31.92 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2638  rhamnulose-1-phosphate aldolase  29.44 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1745  rhamnulose-1-phosphate aldolase  26.41 
 
 		 236 aa  92.4  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0338141  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1672  rhamnulose-1-phosphate aldolase  29.02 
 
 		 236 aa  91.3  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.191632  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  26.32 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  25.68 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  22.52 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  23.11 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4213  class II aldolase/adducin family protein  26.83 
 
 		 235 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511631  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  23.63 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  27.03 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3215  class II aldolase/adducin family protein  29.89 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.549465  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  24.59 
 
 		 221 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  24.84 
 
 		 222 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1661  L-fuculose phosphate aldolase  29.41 
 
 		 180 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  24.84 
 
 		 224 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3384  class II aldolase/adducin family protein  25.25 
 
 		 213 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  24.86 
 
 		 215 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  30.77 
 
 		 225 aa  42.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  22.22 
 
 		 226 aa  42.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  25.33 
 
 		 217 aa  42.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>