66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1116 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1116  Rhamnulose-1-phosphate aldolase  100 
 
 
301 aa  615  1e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000171192  hitchhiker  0.000000000000494113 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3785  Rhamnulose-1-phosphate aldolase  39.02 
 
 
274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0497  rhamnulose-1-phosphate aldolase  40.08 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4433  rhamnulose-1-phosphate aldolase  39.75 
 
 
274 aa  200  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4082  rhamnulose-1-phosphate aldolase  40.16 
 
 
274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4115  rhamnulose-1-phosphate aldolase  40.16 
 
 
274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4130  rhamnulose-1-phosphate aldolase  40.16 
 
 
274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3611  rhamnulose-1-phosphate aldolase  40.24 
 
 
276 aa  199  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0418  rhamnulose-1-phosphate aldolase  40.08 
 
 
274 aa  199  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03788  rhamnulose-1-phosphate aldolase  39.75 
 
 
274 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03737  hypothetical protein  39.75 
 
 
274 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4293  rhamnulose-1-phosphate aldolase  39.75 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5354  rhamnulose-1-phosphate aldolase  39.75 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3487  rhamnulose-1-phosphate aldolase  39.84 
 
 
274 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3847  rhamnulose-1-phosphate aldolase  40.17 
 
 
274 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0745  rhamnulose-1-phosphate aldolase  40.17 
 
 
274 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.103883 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3757  rhamnulose-1-phosphate aldolase  40.17 
 
 
274 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4069  rhamnulose-1-phosphate aldolase  38.91 
 
 
276 aa  188  9e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.703953  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4440  rhamnulose-1-phosphate aldolase  38.49 
 
 
275 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4259  rhamnulose-1-phosphate aldolase  38.49 
 
 
275 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.199258  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4328  rhamnulose-1-phosphate aldolase  38.49 
 
 
275 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.187622 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4374  rhamnulose-1-phosphate aldolase  38.49 
 
 
275 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4288  rhamnulose-1-phosphate aldolase  38.49 
 
 
275 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  41.22 
 
 
471 aa  119  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1745  rhamnulose-1-phosphate aldolase  30.17 
 
 
236 aa  98.2  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0338141  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1672  rhamnulose-1-phosphate aldolase  30.13 
 
 
236 aa  96.7  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.191632  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1581  rhamnulose-1-phosphate aldolase  26.29 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2638  rhamnulose-1-phosphate aldolase  29.22 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  26.99 
 
 
220 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  30.12 
 
 
225 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  30.12 
 
 
224 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  26.97 
 
 
226 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  28.92 
 
 
222 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  25.93 
 
 
228 aa  53.9  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  25 
 
 
221 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  25 
 
 
218 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  22.89 
 
 
219 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  24.64 
 
 
212 aa  51.6  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  30.15 
 
 
189 aa  49.3  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5136  L-fuculose-phosphate aldolase  29.79 
 
 
228 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  27.27 
 
 
220 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  22.66 
 
 
214 aa  48.5  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  26.32 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0814  class II aldolase/adducin family protein  28.37 
 
 
192 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.537097  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  25.95 
 
 
332 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  25 
 
 
215 aa  46.6  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  25.87 
 
 
211 aa  45.8  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3562  L-fuculose-phosphate aldolase  27.53 
 
 
214 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.272655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  28.4 
 
 
214 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3384  class II aldolase/adducin family protein  29.7 
 
 
213 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4066  class II aldolase/adducin family protein  30.2 
 
 
216 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  24.81 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  22.28 
 
 
219 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  23.74 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3215  class II aldolase/adducin family protein  24.2 
 
 
216 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.549465  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  25.97 
 
 
212 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1228  putative L-fuculose phosphate aldolase  29.1 
 
 
224 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642951  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  25 
 
 
227 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  24.81 
 
 
231 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  25 
 
 
222 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  32.31 
 
 
220 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0939  class II aldolase/adducin family protein  25.55 
 
 
185 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.100017 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  27.1 
 
 
222 aa  43.5  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  25.36 
 
 
216 aa  43.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  24.63 
 
 
215 aa  42.7  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  23.31 
 
 
215 aa  42.7  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>