31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1581 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1581  rhamnulose-1-phosphate aldolase  100 
 
 		 274 aa  555  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2638  rhamnulose-1-phosphate aldolase  83.71 
 
 		 287 aa  450  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4069  rhamnulose-1-phosphate aldolase  32.86 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.703953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4433  rhamnulose-1-phosphate aldolase  32.04 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4082  rhamnulose-1-phosphate aldolase  31.55 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4130  rhamnulose-1-phosphate aldolase  31.55 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4115  rhamnulose-1-phosphate aldolase  31.55 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4293  rhamnulose-1-phosphate aldolase  32.04 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5354  rhamnulose-1-phosphate aldolase  32.04 
 
 		 274 aa  102  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3785  Rhamnulose-1-phosphate aldolase  28.3 
 
 		 274 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03788  rhamnulose-1-phosphate aldolase  31.46 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03737  hypothetical protein  31.46 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4328  rhamnulose-1-phosphate aldolase  31.92 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.187622 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4374  rhamnulose-1-phosphate aldolase  31.92 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4259  rhamnulose-1-phosphate aldolase  31.92 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.199258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4288  rhamnulose-1-phosphate aldolase  31.92 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4440  rhamnulose-1-phosphate aldolase  31.92 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0418  rhamnulose-1-phosphate aldolase  30.12 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3611  rhamnulose-1-phosphate aldolase  30.12 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3847  rhamnulose-1-phosphate aldolase  28.8 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0745  rhamnulose-1-phosphate aldolase  28.8 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.103883 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0497  rhamnulose-1-phosphate aldolase  29.72 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3757  rhamnulose-1-phosphate aldolase  28.8 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3487  rhamnulose-1-phosphate aldolase  28.92 
 
 		 274 aa  95.9  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1745  rhamnulose-1-phosphate aldolase  30.49 
 
 		 236 aa  94.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0338141  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1672  rhamnulose-1-phosphate aldolase  31.51 
 
 		 236 aa  89.4  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.191632  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1116  Rhamnulose-1-phosphate aldolase  26.29 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000171192  hitchhiker  0.000000000000494113 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  29.03 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  24.69 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  29.03 
 
 		 212 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  26.35 
 
 		 216 aa  43.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>