59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3487 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3487  rhamnulose-1-phosphate aldolase  100 
 
 		 274 aa  564  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3611  rhamnulose-1-phosphate aldolase  90.88 
 
 		 276 aa  519  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0497  rhamnulose-1-phosphate aldolase  86.45 
 
 		 274 aa  504  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0418  rhamnulose-1-phosphate aldolase  86.45 
 
 		 274 aa  501  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3847  rhamnulose-1-phosphate aldolase  79.41 
 
 		 274 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0745  rhamnulose-1-phosphate aldolase  79.41 
 
 		 274 aa  456  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.103883 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3757  rhamnulose-1-phosphate aldolase  79.41 
 
 		 274 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4082  rhamnulose-1-phosphate aldolase  72.79 
 
 		 274 aa  421  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5354  rhamnulose-1-phosphate aldolase  73.16 
 
 		 274 aa  421  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4293  rhamnulose-1-phosphate aldolase  72.79 
 
 		 274 aa  421  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4115  rhamnulose-1-phosphate aldolase  72.79 
 
 		 274 aa  421  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4130  rhamnulose-1-phosphate aldolase  72.79 
 
 		 274 aa  421  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4069  rhamnulose-1-phosphate aldolase  72.53 
 
 		 276 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.703953  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03788  rhamnulose-1-phosphate aldolase  72.43 
 
 		 274 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03737  hypothetical protein  72.43 
 
 		 274 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4433  rhamnulose-1-phosphate aldolase  72.43 
 
 		 274 aa  419  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4259  rhamnulose-1-phosphate aldolase  70.59 
 
 		 275 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.199258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4440  rhamnulose-1-phosphate aldolase  70.59 
 
 		 275 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4288  rhamnulose-1-phosphate aldolase  70.59 
 
 		 275 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4328  rhamnulose-1-phosphate aldolase  70.59 
 
 		 275 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.187622 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4374  rhamnulose-1-phosphate aldolase  70.59 
 
 		 275 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3785  Rhamnulose-1-phosphate aldolase  54.41 
 
 		 274 aa  319  3e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  74.52 
 
 		 471 aa  253  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1116  Rhamnulose-1-phosphate aldolase  39.84 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000171192  hitchhiker  0.000000000000494113 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2638  rhamnulose-1-phosphate aldolase  29.73 
 
 		 287 aa  105  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1581  rhamnulose-1-phosphate aldolase  28.92 
 
 		 274 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1745  rhamnulose-1-phosphate aldolase  27.27 
 
 		 236 aa  87.8  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0338141  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1672  rhamnulose-1-phosphate aldolase  27.71 
 
 		 236 aa  85.1  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.191632  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  28.02 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  27.75 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  27.17 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  23.23 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  22.01 
 
 		 214 aa  49.7  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  23.63 
 
 		 212 aa  48.9  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  24.53 
 
 		 226 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  24.7 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  26.37 
 
 		 220 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  25.14 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  26.23 
 
 		 228 aa  46.6  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  25.82 
 
 		 222 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  25 
 
 		 225 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  24.56 
 
 		 227 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  25.41 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  24.55 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  26.25 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  24.04 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  25.74 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4213  class II aldolase/adducin family protein  25.29 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511631  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  23.11 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  28.24 
 
 		 212 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  25.83 
 
 		 221 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0362  class II aldolase/adducin family protein  29.87 
 
 		 241 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0763324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  25.13 
 
 		 243 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  22.3 
 
 		 222 aa  42.7  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  25.13 
 
 		 231 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3384  class II aldolase/adducin family protein  24.23 
 
 		 213 aa  42.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  23.62 
 
 		 216 aa  42.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  23.28 
 
 		 265 aa  42.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1302  class II aldolase/adducin family protein  27.07 
 
 		 427 aa  42  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>