More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1671 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  99.37 
 
 		 474 aa  968    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 476 aa  977    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2252  carbohydrate kinase FGGY  46.5 
 
 		 493 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00324674  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  44.6 
 
 		 493 aa  414  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  43.06 
 
 		 498 aa  391  1e-107  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  42.74 
 
 		 489 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  44.61 
 
 		 499 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  41.39 
 
 		 476 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  39.92 
 
 		 500 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  38.92 
 
 		 497 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  40.82 
 
 		 497 aa  356  5.999999999999999e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  40.25 
 
 		 480 aa  354  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  40.51 
 
 		 477 aa  353  5e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  41.21 
 
 		 516 aa  351  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  40.25 
 
 		 490 aa  343  4e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  36.58 
 
 		 473 aa  335  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  37.63 
 
 		 496 aa  330  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  39.58 
 
 		 485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  38.04 
 
 		 496 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  42.06 
 
 		 495 aa  322  7e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  34.58 
 
 		 485 aa  317  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  34.36 
 
 		 520 aa  315  9e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  41.16 
 
 		 472 aa  312  5.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  37.34 
 
 		 489 aa  310  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  38.19 
 
 		 528 aa  307  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  34.63 
 
 		 472 aa  306  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  35.27 
 
 		 490 aa  305  9.000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  37.26 
 
 		 485 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  36.25 
 
 		 489 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  36.25 
 
 		 489 aa  302  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  36.25 
 
 		 489 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  36.25 
 
 		 489 aa  302  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  36.03 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  36.03 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  36.03 
 
 		 489 aa  299  8e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  39.14 
 
 		 479 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  36.81 
 
 		 467 aa  298  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  38.48 
 
 		 488 aa  298  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  37.21 
 
 		 477 aa  298  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  33.81 
 
 		 485 aa  296  4e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  36.03 
 
 		 489 aa  296  6e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  35.25 
 
 		 490 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  35.55 
 
 		 489 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  35.55 
 
 		 489 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  35.33 
 
 		 489 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  35.55 
 
 		 489 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  35.33 
 
 		 489 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  34.58 
 
 		 523 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2380  Carbohydrate kinase, FGGY  36.69 
 
 		 502 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3705  carbohydrate kinase FGGY  37.84 
 
 		 470 aa  273  5.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  39.57 
 
 		 506 aa  269  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  32.85 
 
 		 499 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  35.12 
 
 		 468 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  34.51 
 
 		 481 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  34.51 
 
 		 481 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  34.51 
 
 		 481 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  31.68 
 
 		 470 aa  257  3e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  35.79 
 
 		 473 aa  257  3e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  33.75 
 
 		 499 aa  256  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  34.27 
 
 		 464 aa  249  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  36.51 
 
 		 518 aa  249  6e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  33.83 
 
 		 482 aa  236  9e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  38.69 
 
 		 471 aa  204  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  36.86 
 
 		 579 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  23.36 
 
 		 474 aa  100  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  25.18 
 
 		 472 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  25.18 
 
 		 482 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  25.18 
 
 		 482 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  25.18 
 
 		 472 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  24.82 
 
 		 472 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  25.18 
 
 		 482 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  23.72 
 
 		 472 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  23.52 
 
 		 472 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  24.33 
 
 		 472 aa  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  22.71 
 
 		 502 aa  89  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  23.95 
 
 		 472 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  23.95 
 
 		 472 aa  87.8  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  23.95 
 
 		 472 aa  87.8  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  23.95 
 
 		 472 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  19.96 
 
 		 485 aa  84.7  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0613  carbohydrate kinase, FGGY  25.5 
 
 		 481 aa  83.2  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.116215  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  23.13 
 
 		 499 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  23.06 
 
 		 487 aa  76.6  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  23.9 
 
 		 507 aa  70.1  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1429  glycerol kinase  25.54 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0184137  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  26.09 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  25.22 
 
 		 494 aa  67  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0342  glycerol kinase  24.46 
 
 		 497 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00293212  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  21.66 
 
 		 500 aa  66.6  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  21.64 
 
 		 509 aa  66.6  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  22.8 
 
 		 492 aa  66.6  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  22.8 
 
 		 492 aa  66.6  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  25.66 
 
 		 507 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  25.66 
 
 		 507 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  25.66 
 
 		 507 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0934  glycerol kinase  25.24 
 
 		 527 aa  64.3  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  25.3 
 
 		 495 aa  64.3  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3466  glycerol kinase  25.54 
 
 		 498 aa  64.7  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0225971  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  20.88 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  24.92 
 
 		 495 aa  63.9  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>