More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29650 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  100 
 
 		 518 aa  1013    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  48.62 
 
 		 499 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  47.31 
 
 		 499 aa  353  5e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  46.25 
 
 		 480 aa  352  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  44.95 
 
 		 477 aa  351  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  48.28 
 
 		 488 aa  347  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  47.46 
 
 		 464 aa  347  3e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2252  carbohydrate kinase FGGY  44.47 
 
 		 493 aa  344  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00324674  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  45.24 
 
 		 523 aa  342  7e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  36.42 
 
 		 476 aa  331  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  44.35 
 
 		 485 aa  329  7e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  35.67 
 
 		 493 aa  320  5e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2380  Carbohydrate kinase, FGGY  45.29 
 
 		 502 aa  316  5e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  44.88 
 
 		 472 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  42.8 
 
 		 477 aa  313  4.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  39.54 
 
 		 520 aa  313  5.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  40.85 
 
 		 496 aa  313  5.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  39.06 
 
 		 489 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  39.06 
 
 		 489 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  39.06 
 
 		 489 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  39.06 
 
 		 489 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  39.06 
 
 		 489 aa  310  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  40.65 
 
 		 489 aa  310  4e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  41.92 
 
 		 516 aa  310  4e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  39.06 
 
 		 489 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  38.85 
 
 		 489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  42.27 
 
 		 479 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  36.33 
 
 		 467 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  38.65 
 
 		 489 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  44.54 
 
 		 481 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  44.54 
 
 		 481 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  44.54 
 
 		 481 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  43.67 
 
 		 495 aa  304  3.0000000000000004e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  45.9 
 
 		 468 aa  304  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  45.87 
 
 		 506 aa  303  4.0000000000000003e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  34.69 
 
 		 500 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3705  carbohydrate kinase FGGY  45.34 
 
 		 470 aa  302  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  43.65 
 
 		 528 aa  301  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  39.92 
 
 		 485 aa  300  4e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  36.94 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  41.07 
 
 		 490 aa  296  5e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  38.21 
 
 		 489 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  38.21 
 
 		 489 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  38.45 
 
 		 489 aa  296  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  38.01 
 
 		 489 aa  296  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  33.06 
 
 		 473 aa  294  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  38.24 
 
 		 489 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  40.24 
 
 		 496 aa  292  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  41.89 
 
 		 490 aa  292  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  35.76 
 
 		 498 aa  290  6e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  42.71 
 
 		 499 aa  290  6e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  39.51 
 
 		 497 aa  288  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  34.84 
 
 		 485 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  42.57 
 
 		 473 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  39.15 
 
 		 472 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  41.07 
 
 		 490 aa  267  4e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  34.39 
 
 		 497 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  30.85 
 
 		 470 aa  257  3e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  36.92 
 
 		 476 aa  256  7e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  36.92 
 
 		 474 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  35.12 
 
 		 482 aa  216  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  28.89 
 
 		 485 aa  211  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  52.79 
 
 		 579 aa  209  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  37.61 
 
 		 471 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  28.98 
 
 		 472 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  28.98 
 
 		 472 aa  114  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  28.88 
 
 		 482 aa  114  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  28.32 
 
 		 472 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  30.56 
 
 		 472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  28.32 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  28.54 
 
 		 482 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  28.54 
 
 		 482 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  24.89 
 
 		 485 aa  104  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  28.93 
 
 		 472 aa  93.6  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  28.96 
 
 		 472 aa  93.2  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  29.78 
 
 		 472 aa  93.2  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  26.74 
 
 		 474 aa  93.2  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  28.96 
 
 		 472 aa  90.9  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  28.69 
 
 		 472 aa  90.5  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  21.15 
 
 		 502 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  23.88 
 
 		 497 aa  69.7  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3770  carbohydrate kinase  26.3 
 
 		 502 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4826  carbohydrate kinase, FGGY family  25.97 
 
 		 502 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  27.21 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  26.79 
 
 		 508 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  26.11 
 
 		 530 aa  62  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  25.6 
 
 		 500 aa  62.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.11 
 
 		 530 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  27.64 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.02 
 
 		 530 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1661  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.87 
 
 		 530 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.68331 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1593  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.8 
 
 		 530 aa  60.8  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  25.74 
 
 		 508 aa  60.5  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  25.27 
 
 		 515 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3991  putative sugar kinase  26.14 
 
 		 494 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.858143 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  21.7 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  25.87 
 
 		 500 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  22.92 
 
 		 509 aa  59.3  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4062  carbohydrate kinase FGGY family protein  25.82 
 
 		 494 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.901874  normal  0.925843 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.23 
 
 		 530 aa  58.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.189864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>