More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3770 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3991  putative sugar kinase  62.73 
 
 		 494 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.858143 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4112  putative sugar kinase  62.73 
 
 		 494 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3770  carbohydrate kinase  100 
 
 		 502 aa  1039    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4826  carbohydrate kinase, FGGY family  97.81 
 
 		 502 aa  1015    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4007  putative sugar  62.93 
 
 		 494 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4062  carbohydrate kinase FGGY family protein  62.93 
 
 		 494 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.901874  normal  0.925843 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  34.13 
 
 		 502 aa  293  7e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  31.99 
 
 		 508 aa  168  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0613  carbohydrate kinase, FGGY  26.02 
 
 		 481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.116215  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  30.77 
 
 		 508 aa  156  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1584  carbohydrate kinase FGGY  26.46 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  25.21 
 
 		 497 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1269  carbohydrate kinase FGGY  29.45 
 
 		 512 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.237373  normal  0.4507 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  26.59 
 
 		 519 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  26.3 
 
 		 530 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  23.78 
 
 		 496 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  25.16 
 
 		 512 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2627  glycerol kinase  26.37 
 
 		 483 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598987  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0722  carbohydrate kinase, FGGY  28.29 
 
 		 491 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.285117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  26.2 
 
 		 514 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0962  glycerol kinase  26.39 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  28.19 
 
 		 508 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1065  glycerol kinase  24.79 
 
 		 500 aa  117  5e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000150653  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  28.45 
 
 		 494 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  26.76 
 
 		 498 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0140  glycerol kinase  27.74 
 
 		 493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0145191  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  24.29 
 
 		 493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  27.92 
 
 		 494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1515  glycerol kinase  28.29 
 
 		 484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  27.6 
 
 		 496 aa  115  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  23.79 
 
 		 501 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0876  glycerol kinase  28.04 
 
 		 497 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  22.84 
 
 		 518 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  25.51 
 
 		 504 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  26.72 
 
 		 491 aa  114  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  24.12 
 
 		 512 aa  113  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  26.69 
 
 		 495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  27.44 
 
 		 548 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  25.06 
 
 		 488 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  25.06 
 
 		 488 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2002  glycerol kinase  28.19 
 
 		 500 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  25.33 
 
 		 509 aa  110  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  25.83 
 
 		 488 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  24.35 
 
 		 503 aa  110  8.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  25.71 
 
 		 513 aa  109  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1429  glycerol kinase  24.22 
 
 		 479 aa  109  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0184137  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1325  glycerol kinase  28.98 
 
 		 484 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.597803  normal  0.0494586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  26.44 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  26.52 
 
 		 487 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  24.9 
 
 		 538 aa  109  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  21.19 
 
 		 505 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4817  glycerol kinase  24.34 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.274509 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2590  glycerol kinase  27.11 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0112292  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  23.12 
 
 		 500 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  24.6 
 
 		 488 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  22.97 
 
 		 512 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  24.55 
 
 		 499 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  23.37 
 
 		 515 aa  107  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  25.46 
 
 		 486 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  25.45 
 
 		 494 aa  107  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  23.49 
 
 		 499 aa  107  6e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  25.54 
 
 		 511 aa  107  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  22.52 
 
 		 512 aa  107  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  27.92 
 
 		 498 aa  107  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  22.75 
 
 		 512 aa  107  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  26.24 
 
 		 490 aa  106  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  22.61 
 
 		 509 aa  106  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  26.24 
 
 		 490 aa  106  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  26.81 
 
 		 472 aa  106  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  26.24 
 
 		 490 aa  106  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  26.24 
 
 		 490 aa  106  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  26.81 
 
 		 482 aa  106  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  24.17 
 
 		 505 aa  106  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  26.81 
 
 		 482 aa  106  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  26.81 
 
 		 472 aa  106  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  22.94 
 
 		 512 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  26.81 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  27.56 
 
 		 506 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  23.64 
 
 		 496 aa  106  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3566  glycerol kinase  27.08 
 
 		 492 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.263401  normal  0.0252805 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  26.81 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0273  glycerol kinase  24.73 
 
 		 502 aa  105  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  24.07 
 
 		 493 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  26.26 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1485  glycerol kinase  25.22 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00136931  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  24.36 
 
 		 512 aa  105  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  26.36 
 
 		 501 aa  104  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0470  glycerol kinase  25.66 
 
 		 499 aa  105  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3223  glycerol kinase  27.47 
 
 		 497 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  27 
 
 		 493 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  22.17 
 
 		 492 aa  104  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  27 
 
 		 493 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  22.17 
 
 		 492 aa  104  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  27 
 
 		 493 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  22.3 
 
 		 512 aa  104  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  22.3 
 
 		 511 aa  104  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  26.59 
 
 		 482 aa  104  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  24.46 
 
 		 501 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  21.55 
 
 		 502 aa  103  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  26.35 
 
 		 500 aa  103  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>