More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0613 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0613  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 
481 aa  982    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.116215  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  27.01 
 
 
502 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  27.11 
 
 
508 aa  170  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  26.65 
 
 
508 aa  167  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  26.96 
 
 
497 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3770  carbohydrate kinase  26.02 
 
 
502 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4826  carbohydrate kinase, FGGY family  26.02 
 
 
502 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1269  carbohydrate kinase FGGY  27.7 
 
 
512 aa  159  9e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.237373  normal  0.4507 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  25.38 
 
 
492 aa  147  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  25.38 
 
 
492 aa  147  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4062  carbohydrate kinase FGGY family protein  25.96 
 
 
494 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.901874  normal  0.925843 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4007  putative sugar  25.96 
 
 
494 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3991  putative sugar kinase  25.96 
 
 
494 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.858143 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4112  putative sugar kinase  25.96 
 
 
494 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189365  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1584  carbohydrate kinase FGGY  27.97 
 
 
449 aa  140  7e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0722  carbohydrate kinase, FGGY  24.89 
 
 
491 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.285117  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  25.4 
 
 
503 aa  131  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  24.63 
 
 
499 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  23.68 
 
 
499 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  22.27 
 
 
481 aa  128  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  24.57 
 
 
489 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  24.79 
 
 
496 aa  126  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  22.11 
 
 
483 aa  124  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  23.01 
 
 
485 aa  124  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  21.92 
 
 
486 aa  123  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  22.47 
 
 
493 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  22.25 
 
 
493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  25.88 
 
 
490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  22.55 
 
 
487 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  22.25 
 
 
493 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  22.25 
 
 
493 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  21.21 
 
 
484 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  21.21 
 
 
484 aa  120  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  22.93 
 
 
486 aa  120  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  21.21 
 
 
484 aa  120  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  24.44 
 
 
548 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  24.53 
 
 
538 aa  119  9e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  21.56 
 
 
481 aa  119  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  22.03 
 
 
493 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3936  carbohydrate kinase FGGY  22.8 
 
 
493 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  22.04 
 
 
512 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0492  carbohydrate kinase FGGY  25.15 
 
 
476 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  25.15 
 
 
476 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  22.86 
 
 
492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  21.53 
 
 
484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  22.03 
 
 
493 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  21.49 
 
 
494 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  22.89 
 
 
485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  22.22 
 
 
485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  24.51 
 
 
502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  23.25 
 
 
505 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  23.8 
 
 
505 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  21.26 
 
 
486 aa  114  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  21.96 
 
 
501 aa  115  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  21.21 
 
 
484 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  22.32 
 
 
478 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  24.14 
 
 
509 aa  114  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  21.21 
 
 
484 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  21.21 
 
 
484 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  21.65 
 
 
493 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  22.8 
 
 
486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  21.21 
 
 
484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  21.41 
 
 
484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  21.21 
 
 
484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  21.21 
 
 
484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  23.18 
 
 
496 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  21.21 
 
 
484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  21.65 
 
 
485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  22.76 
 
 
482 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  20.9 
 
 
488 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  23.82 
 
 
515 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  22.58 
 
 
509 aa  110  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  22.54 
 
 
495 aa  109  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  22.36 
 
 
485 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  20.84 
 
 
490 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  23.03 
 
 
511 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  20.84 
 
 
490 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  21.85 
 
 
483 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  20.84 
 
 
490 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  20.84 
 
 
490 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  21.6 
 
 
530 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  22.35 
 
 
489 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  23.18 
 
 
518 aa  106  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  20.77 
 
 
493 aa  106  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  20.8 
 
 
493 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  22.67 
 
 
484 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  21.24 
 
 
493 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  20.88 
 
 
484 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  22.15 
 
 
483 aa  104  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  22.36 
 
 
483 aa  104  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  20.86 
 
 
485 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  22.1 
 
 
478 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  21.08 
 
 
484 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  22.1 
 
 
478 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  23.12 
 
 
505 aa  104  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  20.88 
 
 
484 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  20.79 
 
 
494 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  21.15 
 
 
491 aa  103  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  20.88 
 
 
484 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  21.49 
 
 
509 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>