More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3845 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  99.58 
 
 		 485 aa  972    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  100 
 
 		 520 aa  978    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  100 
 
 		 472 aa  976    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  64.33 
 
 		 489 aa  624  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  62 
 
 		 489 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  62 
 
 		 489 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  62 
 
 		 489 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0691147 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  62 
 
 		 489 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  62 
 
 		 489 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  61.78 
 
 		 489 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  61.57 
 
 		 489 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  61.57 
 
 		 489 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  61.78 
 
 		 489 aa  600  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  61.57 
 
 		 489 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  61.57 
 
 		 489 aa  598  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  61.78 
 
 		 489 aa  597  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  61.57 
 
 		 489 aa  597  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  58.9 
 
 		 490 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  61.29 
 
 		 496 aa  580  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  61.94 
 
 		 496 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  59.11 
 
 		 490 aa  566  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  64.09 
 
 		 471 aa  405  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  42.58 
 
 		 485 aa  365  1e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  42.44 
 
 		 477 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  36.42 
 
 		 493 aa  326  5e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  42.83 
 
 		 480 aa  320  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2252  carbohydrate kinase FGGY  40.62 
 
 		 493 aa  318  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00324674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  43.62 
 
 		 488 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  37.41 
 
 		 467 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  42.22 
 
 		 485 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  34.77 
 
 		 500 aa  309  5.9999999999999995e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  35.06 
 
 		 474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  36.08 
 
 		 498 aa  306  4.0000000000000004e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  34.63 
 
 		 476 aa  306  6e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  36.52 
 
 		 497 aa  301  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  35.87 
 
 		 473 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  39.64 
 
 		 479 aa  296  6e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  36.08 
 
 		 476 aa  295  8e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  38.35 
 
 		 516 aa  293  6e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  38.03 
 
 		 528 aa  290  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  41.07 
 
 		 495 aa  289  6e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  38.88 
 
 		 490 aa  289  7e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  33.33 
 
 		 489 aa  288  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  42.16 
 
 		 464 aa  288  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  39.12 
 
 		 523 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  40.79 
 
 		 472 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  39.69 
 
 		 499 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  35.46 
 
 		 497 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  38.28 
 
 		 518 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  38.6 
 
 		 499 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  39.46 
 
 		 468 aa  260  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  36.61 
 
 		 477 aa  260  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3705  carbohydrate kinase FGGY  38.53 
 
 		 470 aa  259  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  37.45 
 
 		 481 aa  256  8e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  37.45 
 
 		 481 aa  256  8e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  37.45 
 
 		 481 aa  256  8e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  39.19 
 
 		 499 aa  253  7e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  35.1 
 
 		 482 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  31.32 
 
 		 470 aa  240  4e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  30.94 
 
 		 485 aa  235  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2380  Carbohydrate kinase, FGGY  38.39 
 
 		 502 aa  234  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  38.37 
 
 		 473 aa  231  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  37.76 
 
 		 506 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  39.2 
 
 		 579 aa  145  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  27.15 
 
 		 472 aa  114  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  27.15 
 
 		 472 aa  113  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  26.89 
 
 		 482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  26.89 
 
 		 482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  26.63 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  26.63 
 
 		 472 aa  110  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  26.63 
 
 		 472 aa  110  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  27.13 
 
 		 482 aa  110  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  24.15 
 
 		 485 aa  110  7.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  26.09 
 
 		 474 aa  109  9.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  27.08 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  27.08 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  26.82 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  27.13 
 
 		 472 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  30.97 
 
 		 472 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  23.28 
 
 		 502 aa  83.2  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  25.81 
 
 		 500 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  32 
 
 		 509 aa  81.3  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  23.3 
 
 		 514 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  20.45 
 
 		 500 aa  79.7  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  20.1 
 
 		 505 aa  78.6  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  24.45 
 
 		 512 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  23.94 
 
 		 513 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  23.94 
 
 		 513 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  23.94 
 
 		 513 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  23.94 
 
 		 513 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  23.94 
 
 		 513 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  29.68 
 
 		 509 aa  76.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1429  glycerol kinase  22.61 
 
 		 479 aa  75.9  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0184137  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  22.44 
 
 		 513 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  33.6 
 
 		 519 aa  76.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  23.19 
 
 		 513 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3403  carbohydrate kinase FGGY  30.57 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  24.11 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  24.11 
 
 		 511 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0932  cryptic L-xylulose kinase  30.57 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.613284  normal  0.355082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>