More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3705 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3705  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
470 aa  930    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  55.81 
 
 
481 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  55.81 
 
 
481 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  55.81 
 
 
481 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  51.94 
 
 
523 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  54.84 
 
 
472 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  51.48 
 
 
499 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  52.89 
 
 
477 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  55.39 
 
 
506 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2380  Carbohydrate kinase, FGGY  55.74 
 
 
502 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2252  carbohydrate kinase FGGY  47.47 
 
 
493 aa  402  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00324674  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  50 
 
 
464 aa  391  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  51.36 
 
 
499 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  47.65 
 
 
477 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  46.17 
 
 
516 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  50.43 
 
 
499 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  49.58 
 
 
488 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  46.3 
 
 
480 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  47.88 
 
 
528 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  40.21 
 
 
476 aa  359  5e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  50.85 
 
 
468 aa  355  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  47.3 
 
 
485 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  40.21 
 
 
489 aa  353  4e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  38.97 
 
 
493 aa  341  1e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  47.49 
 
 
495 aa  337  3.9999999999999995e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  36.23 
 
 
500 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  44.75 
 
 
479 aa  334  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  36.99 
 
 
473 aa  331  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  37.29 
 
 
498 aa  329  7e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  45.11 
 
 
490 aa  329  7e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  42.62 
 
 
496 aa  326  5e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  45.22 
 
 
473 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  45.34 
 
 
518 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  42.07 
 
 
496 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  37.29 
 
 
485 aa  309  6.999999999999999e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  44.21 
 
 
490 aa  309  8e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  42.09 
 
 
490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  40.4 
 
 
485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  40.04 
 
 
497 aa  304  2.0000000000000002e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  40.18 
 
 
520 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  40.68 
 
 
489 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  40.17 
 
 
489 aa  295  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  40.17 
 
 
489 aa  295  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  40.17 
 
 
489 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  37.92 
 
 
476 aa  293  3e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  39.96 
 
 
489 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  34.38 
 
 
497 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  39.96 
 
 
489 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  39.07 
 
 
489 aa  292  7e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  38.85 
 
 
489 aa  292  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  38.85 
 
 
489 aa  292  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  38.85 
 
 
489 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  37.82 
 
 
474 aa  290  3e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  38.85 
 
 
489 aa  289  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  36.77 
 
 
467 aa  289  7e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  38.64 
 
 
489 aa  289  8e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  38.64 
 
 
489 aa  289  8e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  38.43 
 
 
489 aa  287  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  39.31 
 
 
472 aa  283  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  32.19 
 
 
470 aa  281  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  38.85 
 
 
482 aa  260  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  32.62 
 
 
485 aa  260  3e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  57.33 
 
 
579 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  37.5 
 
 
471 aa  203  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  27.33 
 
 
474 aa  99  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  26.51 
 
 
472 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  26.28 
 
 
472 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  26.25 
 
 
482 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  26.25 
 
 
482 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  26.84 
 
 
472 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  26.25 
 
 
482 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  26.84 
 
 
472 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  26.52 
 
 
472 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  26.25 
 
 
472 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  26.03 
 
 
472 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  26.77 
 
 
472 aa  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  26.6 
 
 
472 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  26.7 
 
 
472 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4288  autoinducer-2 (AI-2) kinase  28.26 
 
 
516 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4318  autoinducer-2 (AI-2) kinase  28.26 
 
 
516 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4400  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.72 
 
 
516 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167986  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4403  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.72 
 
 
516 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00650936  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4470  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.72 
 
 
516 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.73 
 
 
530 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1661  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.47 
 
 
530 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.68331 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2703  carbohydrate kinase FGGY  27.37 
 
 
521 aa  83.6  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  27.47 
 
 
530 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.47 
 
 
530 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1593  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.2 
 
 
530 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3518  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.86 
 
 
530 aa  80.1  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3648  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.86 
 
 
530 aa  80.1  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0855  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.55 
 
 
530 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  21.22 
 
 
485 aa  78.6  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  24.65 
 
 
492 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  24.65 
 
 
492 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0049  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.17 
 
 
517 aa  73.9  0.000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  24.61 
 
 
500 aa  73.6  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  21.28 
 
 
505 aa  71.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2124  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.25 
 
 
530 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359272  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  25.42 
 
 
518 aa  66.6  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>