More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5356 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  98.98 
 
 		 489 aa  1004    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  99.59 
 
 		 489 aa  1011    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  99.05 
 
 		 471 aa  659    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  80.98 
 
 		 489 aa  841    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  99.59 
 
 		 489 aa  1011    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  81.19 
 
 		 489 aa  843    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  100 
 
 		 489 aa  1014    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  80.78 
 
 		 489 aa  838    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  81.19 
 
 		 489 aa  843    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  99.59 
 
 		 489 aa  1011    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  98.98 
 
 		 489 aa  1004    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  98.77 
 
 		 489 aa  1005    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  97.75 
 
 		 489 aa  993    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  81.19 
 
 		 489 aa  843    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  78.94 
 
 		 489 aa  800    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  62.35 
 
 		 520 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  62.73 
 
 		 485 aa  623  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  61.78 
 
 		 472 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  57.94 
 
 		 496 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  57 
 
 		 490 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  58.14 
 
 		 496 aa  560  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  56.38 
 
 		 490 aa  545  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  41.84 
 
 		 485 aa  366  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  40.33 
 
 		 493 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  40.86 
 
 		 467 aa  346  5e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  43.71 
 
 		 488 aa  339  5.9999999999999996e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  41.88 
 
 		 477 aa  338  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  38.53 
 
 		 476 aa  338  9.999999999999999e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2252  carbohydrate kinase FGGY  40.83 
 
 		 493 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00324674  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  41.84 
 
 		 497 aa  332  7.000000000000001e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  40.99 
 
 		 480 aa  332  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  37.35 
 
 		 500 aa  329  6e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  41.47 
 
 		 485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  40.96 
 
 		 516 aa  325  9e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  39.96 
 
 		 479 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  36.23 
 
 		 473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  40.51 
 
 		 490 aa  312  7.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  41.79 
 
 		 495 aa  311  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  40.76 
 
 		 464 aa  311  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  36.67 
 
 		 474 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  41.93 
 
 		 499 aa  302  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  38.49 
 
 		 518 aa  301  1e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  36.25 
 
 		 476 aa  301  1e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  36.7 
 
 		 498 aa  301  2e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  35.79 
 
 		 489 aa  298  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05830  pentulose/hexulose kinase  38.66 
 
 		 523 aa  296  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.628085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  40.22 
 
 		 472 aa  296  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  40.08 
 
 		 499 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  38.61 
 
 		 477 aa  290  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  35.03 
 
 		 497 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3105  carbohydrate kinase FGGY  40.25 
 
 		 499 aa  282  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  35.94 
 
 		 528 aa  279  7e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  35.23 
 
 		 482 aa  266  8.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2380  Carbohydrate kinase, FGGY  38.97 
 
 		 502 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  37.07 
 
 		 468 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3705  carbohydrate kinase FGGY  37.79 
 
 		 470 aa  265  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  37.21 
 
 		 481 aa  264  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  37.21 
 
 		 481 aa  264  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  37.21 
 
 		 481 aa  264  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  38.19 
 
 		 473 aa  262  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  39.18 
 
 		 506 aa  260  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  31.66 
 
 		 470 aa  249  7e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  31.11 
 
 		 485 aa  241  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2655  carbohydrate kinase FGGY  37.87 
 
 		 579 aa  156  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379361  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  24.76 
 
 		 485 aa  108  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  24.94 
 
 		 474 aa  91.7  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  25.42 
 
 		 472 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  25.42 
 
 		 472 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  24.76 
 
 		 472 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  25.89 
 
 		 482 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  25.18 
 
 		 472 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  25.89 
 
 		 482 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  25.7 
 
 		 472 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  25.18 
 
 		 472 aa  89  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  24.76 
 
 		 472 aa  87.8  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  24.94 
 
 		 482 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  24.52 
 
 		 472 aa  87  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  21.3 
 
 		 505 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  24.52 
 
 		 472 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  24.52 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3156  carbohydrate kinase FGGY  22.15 
 
 		 502 aa  84  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3403  carbohydrate kinase FGGY  30.28 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3270  cryptic L-xylulose kinase  30.28 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0932  cryptic L-xylulose kinase  30.28 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.613284  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  29.93 
 
 		 495 aa  72.4  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  26.45 
 
 		 512 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  26.45 
 
 		 511 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  21.43 
 
 		 505 aa  67  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  28.86 
 
 		 493 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  29.35 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  22.42 
 
 		 500 aa  65.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  25.91 
 
 		 530 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  23.76 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  25.71 
 
 		 512 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  29.71 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  24.02 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  20.7 
 
 		 500 aa  64.7  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  25 
 
 		 515 aa  64.7  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  26.45 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  33.59 
 
 		 499 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>