More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3131 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3131  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 481 aa  995    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.735218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3504  carbohydrate kinase FGGY  60.17 
 
 		 482 aa  600  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  26.75 
 
 		 497 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  25.78 
 
 		 492 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  25.78 
 
 		 492 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  26.75 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1593  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.64 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.75 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.75 
 
 		 530 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1661  autoinducer-2 (AI-2) kinase  30.63 
 
 		 530 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.68331 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3648  autoinducer-2 (AI-2) kinase  28.21 
 
 		 530 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0855  autoinducer-2 (AI-2) kinase  28.53 
 
 		 530 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3518  autoinducer-2 (AI-2) kinase  28.21 
 
 		 530 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1477  autoinducer-2 (AI-2) kinase  31.02 
 
 		 520 aa  117  6e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0166671  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4288  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.14 
 
 		 516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4318  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.14 
 
 		 516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1382  autoinducer-2 (AI-2) kinase  28.53 
 
 		 521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  26.68 
 
 		 499 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3151  autoinducer-2 (AI-2) kinase  28.35 
 
 		 509 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3506  autoinducer-2 (AI-2) kinase  28.35 
 
 		 509 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4403  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.96 
 
 		 516 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00650936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4470  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.96 
 
 		 516 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4400  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.96 
 
 		 516 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  25.74 
 
 		 481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  23.5 
 
 		 496 aa  111  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.29 
 
 		 530 aa  110  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2124  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.75 
 
 		 530 aa  110  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359272  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2261  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.13 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0868353 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  23.46 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  23.86 
 
 		 512 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2774  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.44 
 
 		 520 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.235174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3017  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.81 
 
 		 520 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.232483  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  25.4 
 
 		 501 aa  107  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  24.89 
 
 		 486 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2981  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.49 
 
 		 520 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  22.59 
 
 		 505 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2977  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.17 
 
 		 520 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047226 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2698  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.49 
 
 		 522 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  25.84 
 
 		 495 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  24.08 
 
 		 512 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  24.78 
 
 		 513 aa  103  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2718  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.17 
 
 		 522 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  24.56 
 
 		 513 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  24.51 
 
 		 513 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  24.23 
 
 		 474 aa  102  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  24.78 
 
 		 513 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  24.78 
 
 		 513 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  24.78 
 
 		 513 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  26 
 
 		 509 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  26.4 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  24.41 
 
 		 538 aa  101  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  24.34 
 
 		 500 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  24.34 
 
 		 513 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  24.71 
 
 		 499 aa  101  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  25.91 
 
 		 530 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0049  autoinducer-2 (AI-2) kinase  28.08 
 
 		 517 aa  100  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3745  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.52 
 
 		 525 aa  100  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  24.78 
 
 		 513 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2768  FGGY family of carbohydrate  23.22 
 
 		 388 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0823721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3019  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.22 
 
 		 520 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  25.62 
 
 		 515 aa  98.2  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  24.07 
 
 		 519 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  24.16 
 
 		 505 aa  97.1  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  23.24 
 
 		 500 aa  97.1  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  24.49 
 
 		 506 aa  96.3  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  24.16 
 
 		 506 aa  96.3  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  30.8 
 
 		 508 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  23.4 
 
 		 512 aa  95.5  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  24.64 
 
 		 506 aa  94.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  26.28 
 
 		 487 aa  95.1  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  25.65 
 
 		 491 aa  94.4  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  22.93 
 
 		 506 aa  94.4  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  23.8 
 
 		 518 aa  94  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  23.79 
 
 		 508 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  26.76 
 
 		 483 aa  93.2  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  23.64 
 
 		 512 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  23.64 
 
 		 511 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  26.27 
 
 		 548 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  23.4 
 
 		 493 aa  91.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  22.75 
 
 		 493 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  29.92 
 
 		 528 aa  90.5  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  23.67 
 
 		 509 aa  90.9  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  23.64 
 
 		 512 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  23.57 
 
 		 493 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  23.57 
 
 		 493 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  23.64 
 
 		 512 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  25.86 
 
 		 484 aa  89  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  22.39 
 
 		 502 aa  89  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  22.2 
 
 		 499 aa  88.6  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  23.13 
 
 		 493 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  24.48 
 
 		 489 aa  88.2  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  23.58 
 
 		 494 aa  87.8  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  24.08 
 
 		 501 aa  87.8  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  23.11 
 
 		 493 aa  87.4  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  23.81 
 
 		 493 aa  87.4  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  22.84 
 
 		 489 aa  87.4  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  21.38 
 
 		 499 aa  87  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  24.18 
 
 		 510 aa  87  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0555  carbohydrate kinase FGGY  23.2 
 
 		 516 aa  86.7  8e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375717  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  23.81 
 
 		 493 aa  86.7  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>