More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3810 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4817  glycerol kinase  63.29 
 
 
500 aa  684    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.274509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1188  glycerol kinase  64.29 
 
 
500 aa  713    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1215  glycerol kinase  64.68 
 
 
500 aa  712    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3810  glycerol kinase  100 
 
 
504 aa  1041    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0347635 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  52.42 
 
 
496 aa  551  1e-156  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  52.82 
 
 
496 aa  554  1e-156  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  51.01 
 
 
497 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  51 
 
 
507 aa  536  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  51.41 
 
 
501 aa  535  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  49.8 
 
 
498 aa  530  1e-149  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  51.11 
 
 
505 aa  527  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  48.59 
 
 
496 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  49.2 
 
 
501 aa  523  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  48.59 
 
 
496 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  50 
 
 
497 aa  522  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  48.59 
 
 
496 aa  520  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  48.59 
 
 
496 aa  520  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  48.59 
 
 
496 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  51.2 
 
 
501 aa  520  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  48.59 
 
 
496 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  49 
 
 
498 aa  520  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  48.39 
 
 
496 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  48.19 
 
 
496 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  49.6 
 
 
497 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  48.39 
 
 
496 aa  514  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  50.1 
 
 
516 aa  511  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  48.89 
 
 
497 aa  511  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  46.98 
 
 
496 aa  510  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  49.1 
 
 
510 aa  508  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  48.79 
 
 
505 aa  506  9.999999999999999e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  49.39 
 
 
494 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  49.09 
 
 
498 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1803  glycerol kinase  47.7 
 
 
509 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0273  glycerol kinase  47.27 
 
 
502 aa  502  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  47.82 
 
 
503 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  48.21 
 
 
502 aa  501  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  47.82 
 
 
503 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  48.19 
 
 
496 aa  501  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  48.1 
 
 
500 aa  502  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  48.3 
 
 
503 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  47.78 
 
 
501 aa  504  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  47.82 
 
 
518 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  47.82 
 
 
518 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  47.82 
 
 
518 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  47.82 
 
 
518 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4187  glycerol kinase  50.81 
 
 
496 aa  501  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  47.82 
 
 
518 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  48.28 
 
 
496 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  47.9 
 
 
507 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1125  glycerol kinase  50 
 
 
510 aa  500  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150114  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  47.98 
 
 
494 aa  498  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  46.95 
 
 
498 aa  498  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  47.9 
 
 
507 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  46.95 
 
 
498 aa  498  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  47.51 
 
 
520 aa  500  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  48.99 
 
 
496 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  47.98 
 
 
494 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45710  glycerol kinase  47.82 
 
 
505 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  48.39 
 
 
503 aa  501  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  47.9 
 
 
507 aa  499  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  47.59 
 
 
502 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  47.59 
 
 
502 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  50.3 
 
 
489 aa  495  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  47.6 
 
 
501 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  47.6 
 
 
501 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  47.08 
 
 
500 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1531  glycerol kinase  48 
 
 
504 aa  497  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403909  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  47.59 
 
 
502 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  47.5 
 
 
502 aa  497  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  47.59 
 
 
502 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  47.59 
 
 
502 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  47.69 
 
 
495 aa  498  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  48.19 
 
 
502 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  47.59 
 
 
502 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  48.19 
 
 
502 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  45.88 
 
 
503 aa  496  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  47.98 
 
 
494 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  46.8 
 
 
505 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  48.19 
 
 
502 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  47.78 
 
 
494 aa  498  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  48.19 
 
 
502 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  46.8 
 
 
505 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  47.59 
 
 
502 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  47.59 
 
 
502 aa  496  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  48.19 
 
 
502 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  47.59 
 
 
502 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  47.59 
 
 
502 aa  495  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  46.6 
 
 
499 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1916  glycerol kinase  49.6 
 
 
496 aa  493  9.999999999999999e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0267705  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  45.73 
 
 
499 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  48.08 
 
 
494 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  48.28 
 
 
494 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0876  glycerol kinase  48.02 
 
 
497 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  47.79 
 
 
503 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  48.69 
 
 
496 aa  491  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0342  glycerol kinase  48.17 
 
 
497 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00293212  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  48.59 
 
 
493 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  47.39 
 
 
503 aa  494  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  48.08 
 
 
494 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  48.08 
 
 
494 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>