More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0105 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0105  ABC transporter related protein  100 
 
 
286 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750026  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1155  ABC transporter related  77.06 
 
 
256 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0959835  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1228  ABC transporter related  73.73 
 
 
257 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178729 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3016  ABC transporter related  72.15 
 
 
260 aa  362  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1975  ABC transporter related protein  73.31 
 
 
279 aa  359  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  70.04 
 
 
290 aa  350  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2206  ABC transporter related  73.31 
 
 
271 aa  350  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2891  ABC transporter related protein  69.75 
 
 
284 aa  346  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  67.93 
 
 
280 aa  345  4e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  67.8 
 
 
289 aa  342  4e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  52.7 
 
 
247 aa  265  8e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  52.36 
 
 
237 aa  255  5e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  48.47 
 
 
276 aa  252  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3969  ABC transporter related protein  52.26 
 
 
249 aa  247  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  50.21 
 
 
277 aa  244  9e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  50.21 
 
 
236 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0660  ABC transporter related protein  55.32 
 
 
245 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  54.08 
 
 
243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0815  ATPase  51.05 
 
 
243 aa  239  5e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.07 
 
 
236 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  51.07 
 
 
236 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0884  ABC transporter-like protein protein  53.02 
 
 
242 aa  238  6.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  49.79 
 
 
245 aa  238  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  50.64 
 
 
235 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0924  ABC transporter related  50.21 
 
 
241 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3135  ABC transporter related  49.79 
 
 
242 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0716  ABC transporter related  49.14 
 
 
245 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0745  ABC transporter related  49.14 
 
 
245 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  45.81 
 
 
235 aa  210  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  43.75 
 
 
249 aa  202  6e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  43.59 
 
 
235 aa  202  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2917  ABC transporter related  42.55 
 
 
239 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0600  ABC transporter related  46.98 
 
 
234 aa  199  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0223  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.26 
 
 
241 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851652  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3332  ABC transporter related  45.45 
 
 
235 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.803262  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  44.21 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  45.09 
 
 
235 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  44.4 
 
 
234 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  45.15 
 
 
239 aa  195  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  44.26 
 
 
237 aa  195  7e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  45.45 
 
 
234 aa  195  7e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3089  ABC transporter related protein  46.98 
 
 
234 aa  195  8.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  44.2 
 
 
234 aa  193  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  42.49 
 
 
233 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  46.33 
 
 
245 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  45.49 
 
 
233 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 
233 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  45.11 
 
 
234 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1826  ABC transporter related  45.85 
 
 
239 aa  192  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.514017  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6245  ABC transporter related  48.09 
 
 
239 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284693  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6414  ABC transporter related  48.09 
 
 
239 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0209306  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6647  ABC transporter related  48.09 
 
 
239 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146774  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.81 
 
 
237 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  44.64 
 
 
241 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.81 
 
 
237 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  45.06 
 
 
233 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.81 
 
 
237 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.81 
 
 
237 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.81 
 
 
237 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4467  ABC transporter related  47.58 
 
 
242 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  44.95 
 
 
256 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.36 
 
 
241 aa  190  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  44.75 
 
 
249 aa  191  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  45.49 
 
 
233 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1737  ABC transporter related protein  46.55 
 
 
234 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
236 aa  190  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4656  ABC transporter related  41.74 
 
 
247 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114918 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4524  ABC transporter related  41.74 
 
 
247 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180068  normal  0.792034 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03303  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  43.36 
 
 
237 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0261  ABC transporter related protein  43.36 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3933  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.36 
 
 
233 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 
238 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03256  hypothetical protein  43.36 
 
 
237 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3735  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.36 
 
 
237 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  42.22 
 
 
235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  41.53 
 
 
238 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  41.8 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4770  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.36 
 
 
237 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  44.12 
 
 
234 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  43.81 
 
 
233 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  41.53 
 
 
238 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2095  ABC transporter related  46.98 
 
 
276 aa  189  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.156364  normal  0.0133806 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  43.08 
 
 
270 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0262  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.36 
 
 
237 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1980  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  42.73 
 
 
240 aa  189  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.681741 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 
233 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.04 
 
 
251 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.06 
 
 
233 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 
233 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  43.44 
 
 
238 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  46.88 
 
 
238 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.92 
 
 
237 aa  189  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3652  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.36 
 
 
233 aa  189  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  45.06 
 
 
233 aa  188  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  42.44 
 
 
238 aa  188  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  42.74 
 
 
239 aa  188  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  44.64 
 
 
233 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2963  ABC transporter related  42.04 
 
 
251 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  44.64 
 
 
237 aa  188  9e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0092  ABC transporter related  42.04 
 
 
251 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>