More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3206 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  100 
 
 		 290 aa  593  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2891  ABC transporter related protein  78.82 
 
 		 284 aa  423  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  72.43 
 
 		 280 aa  391  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3016  ABC transporter related  71.32 
 
 		 260 aa  385  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  76.57 
 
 		 289 aa  381  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1228  ABC transporter related  72.46 
 
 		 257 aa  360  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178729 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1155  ABC transporter related  72.88 
 
 		 256 aa  360  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0959835  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0105  ABC transporter related protein  70.04 
 
 		 286 aa  350  2e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750026  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2206  ABC transporter related  71.91 
 
 		 271 aa  343  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1975  ABC transporter related protein  71.49 
 
 		 279 aa  342  2.9999999999999997e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 243 aa  265  8e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  51.72 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  53.65 
 
 		 235 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0660  ABC transporter related protein  55.08 
 
 		 245 aa  251  9.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3969  ABC transporter related protein  54.74 
 
 		 249 aa  250  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  51.75 
 
 		 277 aa  246  3e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  52.07 
 
 		 236 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  50.88 
 
 		 276 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  51.32 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0815  ATPase  51.07 
 
 		 243 aa  241  9e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.79 
 
 		 236 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  51.07 
 
 		 245 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  49.79 
 
 		 236 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0924  ABC transporter related  50 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0884  ABC transporter-like protein protein  52.1 
 
 		 242 aa  239  4e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0716  ABC transporter related  52.36 
 
 		 245 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0745  ABC transporter related  52.36 
 
 		 245 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3135  ABC transporter related  50.86 
 
 		 242 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1737  ABC transporter related protein  51.93 
 
 		 234 aa  222  7e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3089  ABC transporter related protein  52.65 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2095  ABC transporter related  51.07 
 
 		 276 aa  216  4e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.156364  normal  0.0133806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  46.88 
 
 		 258 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  47.5 
 
 		 249 aa  212  7e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  45.81 
 
 		 235 aa  211  9e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  44.93 
 
 		 235 aa  210  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  48.37 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0600  ABC transporter related  47.64 
 
 		 234 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  45.98 
 
 		 237 aa  205  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  46.12 
 
 		 233 aa  205  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4467  ABC transporter related  46.58 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  45.34 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  45.7 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  44.64 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1826  ABC transporter related  43.83 
 
 		 239 aa  201  9e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.514017  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  46.4 
 
 		 238 aa  201  9e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  45.87 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  43.58 
 
 		 243 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2917  ABC transporter related  43.33 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  45.18 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.85 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0093  ABC transporter related  45.85 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  41.52 
 
 		 236 aa  199  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  44.12 
 
 		 265 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6414  ABC transporter related  45.96 
 
 		 239 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0209306  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6647  ABC transporter related  45.96 
 
 		 239 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6245  ABC transporter related  45.96 
 
 		 239 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  42.55 
 
 		 234 aa  199  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  44.12 
 
 		 264 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  45.22 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  42.86 
 
 		 235 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0092  ABC transporter related  46.67 
 
 		 251 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.65269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2963  ABC transporter related  45.41 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  44.02 
 
 		 239 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0092  ABC transporter related  45.41 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  43.18 
 
 		 234 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  45 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  46.46 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.98 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  42.15 
 
 		 233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0083  ABC transporter related  45.41 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  43.3 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  46.61 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0109  ABC transporter related  44.98 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  43.89 
 
 		 238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  44.78 
 
 		 247 aa  195  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  44.34 
 
 		 238 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  45.26 
 
 		 247 aa  196  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  44.75 
 
 		 240 aa  195  7e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  43.69 
 
 		 247 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  43.69 
 
 		 247 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  43.58 
 
 		 238 aa  195  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  43.89 
 
 		 238 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  43.69 
 
 		 247 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  43.89 
 
 		 238 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  43.95 
 
 		 239 aa  195  9e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  43.89 
 
 		 238 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  43.89 
 
 		 238 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  43.89 
 
 		 238 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  42.41 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3510  ABC transporter-related protein  43.48 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  44.83 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4656  ABC transporter related  43.48 
 
 		 247 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114918 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.42 
 
 		 233 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.55 
 
 		 238 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  44.91 
 
 		 237 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  40.85 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4524  ABC transporter related  43.48 
 
 		 247 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180068  normal  0.792034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  43.44 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>