More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1570 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  477  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 		 236 aa  477  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0924  ABC transporter related  95.76 
 
 		 241 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  85.96 
 
 		 277 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  82.28 
 
 		 237 aa  394  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  82.2 
 
 		 276 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  81.78 
 
 		 236 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  59.48 
 
 		 235 aa  288  7e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  52.59 
 
 		 289 aa  254  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0600  ABC transporter related  57.46 
 
 		 234 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  51.29 
 
 		 280 aa  250  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 290 aa  240  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2891  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0105  ABC transporter related protein  51.07 
 
 		 286 aa  238  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750026  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1155  ABC transporter related  50.22 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0959835  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1228  ABC transporter related  49.38 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178729 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3016  ABC transporter related  50.22 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1975  ABC transporter related protein  47.86 
 
 		 279 aa  231  7.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  48.25 
 
 		 245 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3089  ABC transporter related protein  51.77 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2206  ABC transporter related  47.86 
 
 		 271 aa  226  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1737  ABC transporter related protein  49.78 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  45.49 
 
 		 247 aa  224  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  47.98 
 
 		 233 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3969  ABC transporter related protein  47.66 
 
 		 249 aa  220  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  47.26 
 
 		 238 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  47.26 
 
 		 238 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2095  ABC transporter related  50.22 
 
 		 276 aa  219  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.156364  normal  0.0133806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 243 aa  218  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  46.41 
 
 		 238 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  44.68 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  47.53 
 
 		 238 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  45.41 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  46.52 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  43.67 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0660  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 245 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  46.55 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0504  ABC transporter related  47.14 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.46 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.46 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.46 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  46.19 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.46 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.46 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.04 
 
 		 237 aa  208  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6114  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.76 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579004  normal  0.282799 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  45.98 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0803  ABC transporter related  45.61 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0716  ABC transporter related  47 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  45.61 
 
 		 249 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0745  ABC transporter related  47 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3040  ABC transporter related  44.44 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.63 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  45.29 
 
 		 259 aa  206  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  44.21 
 
 		 250 aa  205  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  42.92 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  45.02 
 
 		 235 aa  205  6e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.54 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  43.86 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  43.67 
 
 		 233 aa  204  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  44.84 
 
 		 233 aa  204  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  44.84 
 
 		 233 aa  204  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.84 
 
 		 233 aa  204  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  44.84 
 
 		 233 aa  204  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  44.84 
 
 		 233 aa  204  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  43.22 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  43.95 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  43.22 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3510  ABC transporter-related protein  45.61 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0884  ABC transporter-like protein protein  44.83 
 
 		 242 aa  204  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  45.65 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  44.64 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3135  ABC transporter related  46.08 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  43.5 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2963  ABC transporter related  46.52 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.1 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.3 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0092  ABC transporter related  46.52 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.74 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3339  ABC transporter related  45.06 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  44.2 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  44.84 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  41.95 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  44.3 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  42.41 
 
 		 238 aa  202  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  44.39 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  44.1 
 
 		 249 aa  202  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.75 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  43.97 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0109  ABC transporter related  46.09 
 
 		 251 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03303  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  41.77 
 
 		 237 aa  201  7e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4770  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 		 237 aa  201  7e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3735  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 		 237 aa  201  7e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03256  hypothetical protein  41.77 
 
 		 237 aa  201  7e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0261  ABC transporter related protein  41.77 
 
 		 237 aa  201  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01742  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  46.09 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.823741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0731  ABC transporter related  43.5 
 
 		 237 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3234  ABC transporter related  42.5 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  43.67 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  43.75 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>