More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1155 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1155  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  521  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0959835  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1228  ABC transporter related  91.02 
 
 		 257 aa  480  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178729 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0105  ABC transporter related protein  71.54 
 
 		 286 aa  379  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750026  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3016  ABC transporter related  70.2 
 
 		 260 aa  368  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  72.38 
 
 		 290 aa  363  1e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1975  ABC transporter related protein  67.97 
 
 		 279 aa  363  2e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2206  ABC transporter related  68.85 
 
 		 271 aa  354  8.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  65.73 
 
 		 289 aa  347  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2891  ABC transporter related protein  65.62 
 
 		 284 aa  345  4e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  67.21 
 
 		 280 aa  345  5e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0660  ABC transporter related protein  52.99 
 
 		 245 aa  259  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  51.72 
 
 		 247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  55.07 
 
 		 243 aa  256  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  53.1 
 
 		 277 aa  255  5e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  51.98 
 
 		 237 aa  252  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  49.38 
 
 		 276 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0884  ABC transporter-like protein protein  52.77 
 
 		 242 aa  248  5e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  50.43 
 
 		 245 aa  248  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3969  ABC transporter related protein  51.72 
 
 		 249 aa  245  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0815  ATPase  49.36 
 
 		 243 aa  242  5e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0924  ABC transporter related  50 
 
 		 241 aa  241  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  48.93 
 
 		 235 aa  241  7e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  48.92 
 
 		 236 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0745  ABC transporter related  51.28 
 
 		 245 aa  238  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0716  ABC transporter related  51.28 
 
 		 245 aa  238  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  50.22 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.22 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3135  ABC transporter related  46.55 
 
 		 242 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  45 
 
 		 249 aa  217  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  46.46 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.46 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  45.21 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  45.11 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4467  ABC transporter related  46.58 
 
 		 242 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0600  ABC transporter related  45.06 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.22 
 
 		 251 aa  205  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  44.93 
 
 		 235 aa  205  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  46.35 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  45.95 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  46.43 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2963  ABC transporter related  45.78 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0092  ABC transporter related  45.78 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0092  ABC transporter related  45.78 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.65269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0093  ABC transporter related  44.89 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.59 
 
 		 254 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0109  ABC transporter related  45.33 
 
 		 251 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0083  ABC transporter related  44.89 
 
 		 252 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1244  ABC transporter-like  45.58 
 
 		 233 aa  201  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1737  ABC transporter related protein  48.07 
 
 		 234 aa  201  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  42.74 
 
 		 253 aa  201  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  42.86 
 
 		 270 aa  201  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  44.84 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  44 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  45.66 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3089  ABC transporter related protein  48.5 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1980  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  42.86 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.681741 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  44.44 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  45.95 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4280  ABC transporter related  45.58 
 
 		 233 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1137  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.58 
 
 		 233 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115394 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4524  ABC transporter related  43.11 
 
 		 247 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180068  normal  0.792034 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  44.58 
 
 		 251 aa  199  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  44.26 
 
 		 237 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1154  ABC transporter related  45.13 
 
 		 233 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0140555 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1171  ABC transporter related  45.58 
 
 		 233 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4656  ABC transporter related  43.11 
 
 		 247 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114918 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  41.84 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  43.7 
 
 		 242 aa  198  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  43.7 
 
 		 242 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_003296  RS01742  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  42.26 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.823741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  44.17 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  40.74 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  41.8 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  43.7 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  43.1 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  41.8 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  41.8 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  42.68 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.68 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.1 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  43.61 
 
 		 237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.1 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.1 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.1 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  42.68 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  43.4 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  42.68 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  45.12 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.1 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  43.56 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  42.68 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  42.68 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  44.44 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4307  branched-chain amino acid transport protein BraG  44.69 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50560  branched-chain amino acid transport protein BraG  44.69 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0125838 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  42.13 
 
 		 234 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>