More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3155 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  100 
 
 
289 aa  578  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  78.47 
 
 
280 aa  449  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  76.57 
 
 
290 aa  381  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2891  ABC transporter related protein  75.32 
 
 
284 aa  374  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1228  ABC transporter related  68.15 
 
 
257 aa  352  5e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178729 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3016  ABC transporter related  67.33 
 
 
260 aa  348  5e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1155  ABC transporter related  69.57 
 
 
256 aa  344  8.999999999999999e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0959835  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0105  ABC transporter related protein  67.8 
 
 
286 aa  342  4e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750026  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1975  ABC transporter related protein  67.62 
 
 
279 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2206  ABC transporter related  65.98 
 
 
271 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  53.06 
 
 
276 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  54.31 
 
 
247 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  57.6 
 
 
236 aa  266  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  53.88 
 
 
237 aa  265  5e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  52.54 
 
 
277 aa  262  4e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  59.03 
 
 
243 aa  261  6e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3969  ABC transporter related protein  57.33 
 
 
249 aa  261  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0660  ABC transporter related protein  55.93 
 
 
245 aa  260  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  54.01 
 
 
245 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0884  ABC transporter-like protein protein  54.04 
 
 
242 aa  255  5e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  52.59 
 
 
236 aa  254  8e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  52.59 
 
 
236 aa  254  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  53.88 
 
 
235 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0815  ATPase  51.32 
 
 
243 aa  250  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0924  ABC transporter related  52.16 
 
 
241 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0745  ABC transporter related  53.16 
 
 
245 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0716  ABC transporter related  53.16 
 
 
245 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3135  ABC transporter related  53.02 
 
 
242 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  47.52 
 
 
249 aa  224  1e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0600  ABC transporter related  50.43 
 
 
234 aa  223  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  44.59 
 
 
235 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  48.62 
 
 
245 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1826  ABC transporter related  48.7 
 
 
239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.514017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  46.98 
 
 
256 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  43.97 
 
 
231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  44.93 
 
 
235 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  42.41 
 
 
236 aa  211  7.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6414  ABC transporter related  49.36 
 
 
239 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0209306  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6245  ABC transporter related  49.36 
 
 
239 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284693  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6647  ABC transporter related  49.36 
 
 
239 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146774  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  44.64 
 
 
235 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2095  ABC transporter related  48.72 
 
 
276 aa  211  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.156364  normal  0.0133806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  47.44 
 
 
234 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1737  ABC transporter related protein  49.57 
 
 
234 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3089  ABC transporter related protein  50.44 
 
 
234 aa  210  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  44.64 
 
 
237 aa  209  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  45.75 
 
 
265 aa  208  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  47.27 
 
 
236 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  45.41 
 
 
250 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  43.95 
 
 
233 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  47.27 
 
 
236 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3388  ABC transporter related  48.94 
 
 
239 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  44.2 
 
 
239 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  44.54 
 
 
247 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.41 
 
 
251 aa  205  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  43.97 
 
 
238 aa  205  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.98 
 
 
254 aa  205  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4467  ABC transporter related  46.09 
 
 
242 aa  205  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2917  ABC transporter related  43.72 
 
 
239 aa  205  7e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  47.25 
 
 
242 aa  205  8e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2963  ABC transporter related  44.98 
 
 
251 aa  204  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0092  ABC transporter related  44.98 
 
 
251 aa  204  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  46.15 
 
 
237 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  44.8 
 
 
238 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0092  ABC transporter related  45.41 
 
 
251 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.65269  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  43.81 
 
 
253 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  46.36 
 
 
241 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0083  ABC transporter related  44.98 
 
 
252 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  43.5 
 
 
258 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1980  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  45.81 
 
 
240 aa  203  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.681741 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  43.91 
 
 
234 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  45.45 
 
 
237 aa  203  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3510  ABC transporter-related protein  44.1 
 
 
247 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  41.88 
 
 
234 aa  203  3e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0109  ABC transporter related  44.54 
 
 
251 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  44.21 
 
 
238 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  45.11 
 
 
237 aa  202  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2873  ABC transporter related  46.43 
 
 
252 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296726  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  42.86 
 
 
249 aa  202  5e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0093  ABC transporter related  45.41 
 
 
252 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899173  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  47.27 
 
 
238 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  44.34 
 
 
238 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  46.82 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  44.34 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  44.34 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  44.34 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  43.89 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  46.82 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  43.89 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  43.89 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  43.97 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1566  ABC transporter related  44.87 
 
 
234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.89 
 
 
238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3960  ABC transporter related  48.62 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  43.89 
 
 
238 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1115  ABC transporter related  45.26 
 
 
248 aa  200  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000583905  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.89 
 
 
238 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  42.86 
 
 
246 aa  200  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  42.86 
 
 
234 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  45 
 
 
238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>