More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0815 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0815  ATPase  100 
 
 
243 aa  477  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  61.6 
 
 
247 aa  295  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0884  ABC transporter-like protein protein  60.5 
 
 
242 aa  279  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  59.83 
 
 
245 aa  275  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0716  ABC transporter related  60.94 
 
 
245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0745  ABC transporter related  60.94 
 
 
245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3135  ABC transporter related  57.14 
 
 
242 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3016  ABC transporter related  53.65 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  51.5 
 
 
280 aa  250  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  51.32 
 
 
289 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1975  ABC transporter related protein  52.14 
 
 
279 aa  246  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2891  ABC transporter related protein  51.5 
 
 
284 aa  244  6.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1228  ABC transporter related  50.21 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3969  ABC transporter related protein  52.36 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  51.07 
 
 
290 aa  241  7e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1155  ABC transporter related  49.36 
 
 
256 aa  241  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0959835  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0660  ABC transporter related protein  53.85 
 
 
245 aa  239  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0105  ABC transporter related protein  51.05 
 
 
286 aa  239  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750026  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2206  ABC transporter related  50.85 
 
 
271 aa  231  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  49.79 
 
 
243 aa  229  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  47.66 
 
 
235 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  47.52 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3960  ABC transporter related  50 
 
 
235 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  48.1 
 
 
235 aa  214  7e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  47.48 
 
 
235 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  48.07 
 
 
245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  47.23 
 
 
237 aa  211  7e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1980  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  48.09 
 
 
240 aa  209  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.681741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3843  ABC transporter related  48.29 
 
 
235 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  46.35 
 
 
234 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  45.45 
 
 
234 aa  208  6e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  48.61 
 
 
237 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  48.29 
 
 
235 aa  206  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  49.33 
 
 
258 aa  206  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  49.15 
 
 
236 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  48.31 
 
 
235 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  44.92 
 
 
276 aa  205  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  45.23 
 
 
239 aa  206  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  45.92 
 
 
233 aa  205  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0803  ABC transporter related  48.56 
 
 
252 aa  205  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1908  ABC transporter related  46.78 
 
 
254 aa  205  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  43.64 
 
 
237 aa  205  7e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  46.76 
 
 
234 aa  204  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0329  ABC transporter related  44.21 
 
 
230 aa  204  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287188  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  45.92 
 
 
256 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  46.55 
 
 
237 aa  203  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  47.51 
 
 
234 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  48.13 
 
 
234 aa  202  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  45.53 
 
 
238 aa  202  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  43.28 
 
 
238 aa  202  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  46.15 
 
 
236 aa  202  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  45.62 
 
 
238 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  48.64 
 
 
247 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  48.23 
 
 
243 aa  202  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  43.64 
 
 
236 aa  202  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  48.64 
 
 
247 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  48.64 
 
 
247 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  43.29 
 
 
236 aa  201  7e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  45.49 
 
 
233 aa  201  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  50.46 
 
 
237 aa  201  9e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  43.28 
 
 
238 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  43.59 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  43.28 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  45.06 
 
 
233 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  43.28 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  45.34 
 
 
238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2095  ABC transporter related  50.21 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.156364  normal  0.0133806 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  45.62 
 
 
238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  47.73 
 
 
236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  45.34 
 
 
240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3093  ABC transporter related  47.21 
 
 
245 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  46.09 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  45.57 
 
 
234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  45.06 
 
 
233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  46.54 
 
 
238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  45.62 
 
 
238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  48.07 
 
 
233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  44.07 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  42.31 
 
 
234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  45.16 
 
 
238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0600  ABC transporter related  46.78 
 
 
234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  48.21 
 
 
235 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
238 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  45.06 
 
 
233 aa  199  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  45.16 
 
 
238 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0838  ABC transporter related  48.42 
 
 
239 aa  199  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0796  ABC transporter related  45.49 
 
 
236 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  44.64 
 
 
238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  45.62 
 
 
238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.62 
 
 
238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.88 
 
 
235 aa  199  5e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  43.88 
 
 
239 aa  199  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
234 aa  198  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.41 
 
 
238 aa  198  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 
238 aa  198  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.41 
 
 
238 aa  198  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.41 
 
 
238 aa  198  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.41 
 
 
238 aa  198  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.41 
 
 
238 aa  198  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>