More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3960 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3960  ABC transporter related  100 
 
 		 235 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3843  ABC transporter related  94.89 
 
 		 235 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1544  ABC transporter related  65.52 
 
 		 238 aa  279  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3413  ABC transporter component  58.37 
 
 		 233 aa  242  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  48.28 
 
 		 247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  49.57 
 
 		 245 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0815  ATPase  50 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  50 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0884  ABC transporter-like protein protein  48.71 
 
 		 242 aa  212  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 243 aa  211  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  46.09 
 
 		 236 aa  209  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  50 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0924  ABC transporter related  46.72 
 
 		 241 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  48.62 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1975  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  44.44 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.85 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  45.85 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2206  ABC transporter related  46.64 
 
 		 271 aa  194  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  44.59 
 
 		 249 aa  193  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  43.86 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  46.05 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  46.79 
 
 		 290 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  44.3 
 
 		 276 aa  192  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0660  ABC transporter related protein  49.35 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  44.44 
 
 		 247 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  42.06 
 
 		 234 aa  191  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  44.44 
 
 		 247 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  44.44 
 
 		 247 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  43.59 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  43.16 
 
 		 264 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  45.25 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3016  ABC transporter related  46.35 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1228  ABC transporter related  44.64 
 
 		 257 aa  188  5.999999999999999e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178729 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  39.83 
 
 		 253 aa  187  9e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  40.6 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.48 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  40.08 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3135  ABC transporter related  44.21 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1155  ABC transporter related  43.78 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0959835  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.31 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  42.24 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0383  ABC transporter related  39.48 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0796  ABC transporter related  43.35 
 
 		 236 aa  185  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  43.56 
 
 		 253 aa  185  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2891  ABC transporter related protein  44.64 
 
 		 284 aa  185  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0504  ABC transporter related  44.92 
 
 		 254 aa  184  7e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  42.06 
 
 		 238 aa  184  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  42.06 
 
 		 238 aa  184  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  40.77 
 
 		 236 aa  184  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.6 
 
 		 238 aa  184  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  42.31 
 
 		 239 aa  184  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0716  ABC transporter related  43.78 
 
 		 245 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  42.92 
 
 		 234 aa  184  9e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0745  ABC transporter related  43.78 
 
 		 245 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  41.56 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  40.6 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  42.67 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  42.86 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  38.36 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  37.87 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  41.53 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  44.21 
 
 		 823 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  41.03 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3969  ABC transporter related protein  44.64 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0105  ABC transporter related protein  43.53 
 
 		 286 aa  182  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750026  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.32 
 
 		 238 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  39.32 
 
 		 238 aa  182  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  38.98 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  41.81 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  42.55 
 
 		 235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  38.46 
 
 		 238 aa  181  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1507  ABC transporter related  43.4 
 
 		 243 aa  181  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  39.91 
 
 		 234 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  38.46 
 
 		 238 aa  181  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  41.63 
 
 		 242 aa  181  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  41.2 
 
 		 236 aa  181  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  42.06 
 
 		 234 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  40.6 
 
 		 238 aa  181  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  41.2 
 
 		 238 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  41.03 
 
 		 238 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  38.03 
 
 		 238 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  38.03 
 
 		 238 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  38.03 
 
 		 238 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  41.63 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  40.51 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  42.49 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0575  ABC transporter related  41.53 
 
 		 248 aa  180  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  42.86 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  41.2 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  41.53 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  42.98 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.2 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  38.03 
 
 		 238 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  42.53 
 
 		 236 aa  180  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  38.89 
 
 		 237 aa  180  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5433  ABC transporter related  42.68 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0490  ABC transporter related  43.04 
 
 		 244 aa  180  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0438645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  38.89 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>