More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3135 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3135  ABC transporter related  100 
 
 
242 aa  491  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0745  ABC transporter related  82.99 
 
 
245 aa  387  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0716  ABC transporter related  82.99 
 
 
245 aa  387  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  76.69 
 
 
247 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0884  ABC transporter-like protein protein  78.24 
 
 
242 aa  359  2e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  71.24 
 
 
245 aa  347  9e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3969  ABC transporter related protein  59.23 
 
 
249 aa  287  9e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0815  ATPase  57.14 
 
 
243 aa  279  3e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  55.08 
 
 
235 aa  278  8e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0660  ABC transporter related protein  55.27 
 
 
245 aa  266  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  54.85 
 
 
243 aa  265  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  53.02 
 
 
289 aa  263  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3016  ABC transporter related  53.45 
 
 
260 aa  255  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  51.29 
 
 
280 aa  252  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2891  ABC transporter related protein  50.63 
 
 
284 aa  247  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1228  ABC transporter related  48.71 
 
 
257 aa  246  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1975  ABC transporter related protein  51.29 
 
 
279 aa  245  6e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0105  ABC transporter related protein  49.79 
 
 
286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750026  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  50.86 
 
 
290 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2206  ABC transporter related  49.57 
 
 
271 aa  240  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1155  ABC transporter related  46.55 
 
 
256 aa  237  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0959835  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0600  ABC transporter related  52.79 
 
 
234 aa  236  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2095  ABC transporter related  55.79 
 
 
276 aa  233  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.156364  normal  0.0133806 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  50 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1737  ABC transporter related protein  54.08 
 
 
234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  46.78 
 
 
249 aa  230  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  48.94 
 
 
237 aa  230  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  50.85 
 
 
236 aa  229  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  50.21 
 
 
238 aa  228  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  49.58 
 
 
236 aa  226  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  49.79 
 
 
235 aa  227  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  46.22 
 
 
276 aa  224  9e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  50.43 
 
 
235 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3089  ABC transporter related protein  51.5 
 
 
234 aa  224  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  46.64 
 
 
277 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  50.45 
 
 
235 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  48.1 
 
 
258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  49.36 
 
 
234 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  50.87 
 
 
236 aa  221  7e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  47.88 
 
 
235 aa  221  7e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  46.67 
 
 
237 aa  221  8e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  44.87 
 
 
234 aa  221  8e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.86 
 
 
235 aa  221  9e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  48.73 
 
 
238 aa  221  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  47.9 
 
 
238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  50.21 
 
 
235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  50.43 
 
 
237 aa  219  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
234 aa  219  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  51.28 
 
 
237 aa  218  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  50 
 
 
235 aa  218  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  49.57 
 
 
236 aa  218  6e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  49.15 
 
 
242 aa  218  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  49.15 
 
 
242 aa  218  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  49.15 
 
 
242 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  45.62 
 
 
236 aa  218  7.999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  45.8 
 
 
256 aa  218  8.999999999999998e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0924  ABC transporter related  46.54 
 
 
241 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  46.08 
 
 
236 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.08 
 
 
236 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  48.29 
 
 
234 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  47.23 
 
 
259 aa  217  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  50 
 
 
239 aa  216  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  44.68 
 
 
237 aa  216  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  47.48 
 
 
238 aa  217  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.28 
 
 
247 aa  215  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 
235 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  49.79 
 
 
239 aa  215  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  47.64 
 
 
234 aa  215  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  49.37 
 
 
239 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  48.65 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  50 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1507  ABC transporter related  44.44 
 
 
243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  47.28 
 
 
247 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3093  ABC transporter related  47.66 
 
 
245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  48.74 
 
 
237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  47.46 
 
 
238 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  50.23 
 
 
233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  48.7 
 
 
236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  50 
 
 
244 aa  211  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  45.11 
 
 
234 aa  211  7e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  47.28 
 
 
247 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  48.2 
 
 
234 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  48.72 
 
 
236 aa  211  7.999999999999999e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  46.58 
 
 
234 aa  211  9e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  47.6 
 
 
250 aa  210  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  47.44 
 
 
237 aa  210  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.56 
 
 
236 aa  209  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  46.06 
 
 
240 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  46.31 
 
 
247 aa  209  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  47.01 
 
 
234 aa  210  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  48.2 
 
 
234 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  46.22 
 
 
238 aa  210  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3510  ABC transporter-related protein  46.28 
 
 
247 aa  209  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  46.98 
 
 
245 aa  209  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  45.26 
 
 
231 aa  209  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  45.64 
 
 
240 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  47.86 
 
 
235 aa  209  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  47.86 
 
 
242 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>